RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558379.5

TLE3-213, Transcript of transducin like enhancer of split 3, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TLE3, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TLE3-213	ENST00000558379	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	CDIPT	O14735	213 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	MLNR	O43193	412 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	ZNF728	P0DKX0	622 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	PSMB6	P28072	239 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	FOXC1	Q12948	553 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	OR2A2	Q6IF42	318 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379		Q9N2K0	584 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	NBAS	A2RRP1	2371 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379		A0A0B4J2A0	478 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	MSGN1	A6NI15	193 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	IFNA2	P01563	188 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	RAC2	P15153	192 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	PMEL	P40967	661 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	IL15RA	Q13261	267 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	MPV17L	Q2QL34	196 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	COQ8A	Q8NI60	647 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	NEK7	Q8TDX7	302 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	NMES1	Q9C002	83 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	TEX46	H3BTG2	121 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379		J3QT63	122 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	SNAPIN	O95295	136 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	GRP	P07492	148 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	OR5AC1	P0C628	307 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	MSMP	Q1L6U9	139 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	MOB3A	Q96BX8	217 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	BOD1	Q96IK1	185 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	C12orf57	Q99622	126 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	PROCR	Q9UNN8	238 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	PROB1	E7EW31	1015 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379		J3QW42	95 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	PPY	P01298	95 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	IGLV1-44	P01699	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	NMB	P08949	121 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	SFTPC	P11686	197 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	C4BPB	P20851	252 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	FABP6	P51161	128 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	ERVK11-1	P61568	191 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	RAB32	Q13637	225 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379		Q6P435	159 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379		Q6ZR03	302 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	POC1A	Q8NBT0	407 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	THAP6	Q8TBB0	222 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	CXorf58	Q96LI9	332 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	PKIB	Q9C010	78 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379		F8W036	122 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	TFF1	P04155	84 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	GNRHR	P30968	328 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	HOXC12	P31275	282 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TLE3-213	ENST00000558379	ST8SIA2	Q92186	375 aa		10.62	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms