RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557092.5

NEDD1-209, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-209ENST00000557092 OR51T1Q8NGJ9 327 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 OR4P4Q8NGL7 312 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF596Q8TC21 504 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 CDCA4Q9BXL8 241 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 METTL9Q9H1A3 318 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 OR6C3Q9NZP0 311 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 CKLFQ9UBR5 152 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 TRAV24A0A0B4J272 114 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 A6NDX4 124 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 CSTBP04080 98 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 C11orf88Q6PI97 169 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 ASCL4Q6XD76 172 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 Q6ZTK2 550 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 DTX3Q8N9I9 347 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF485Q8NCK3 441 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 PGLYRP3Q96LB9 341 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 MMP27Q9H306 513 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF286AQ9HBT8 521 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 KIF25Q9UIL4 384 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 ST3GAL6Q9Y274 331 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD1-209ENST00000557092 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 MEIKINA0A087WXM9 373 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 TOR1AO14656 332 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 VSIG10L2P0DP72 767 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 SERPINA2P20848 420 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 NFYBP25208 207 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 DYNLT3P51808 116 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 HERPUD1Q15011 391 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 OSR2Q8N2R0 312 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 KLHDC1Q8N7A1 406 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 OR14A2Q96R54 314 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 DCLRE1BQ9H816 532 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 IL36GQ9NZH8 169 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 DPM3Q9P2X0 92 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 FOXJ3Q9UPW0 622 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 A0A1W2PPK0 400 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 CD34P28906 385 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 KCNJ3P48549 501 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 WNT4P56705 351 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 BDH1Q02338 343 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 C17orf58Q2M2W7 97 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 C2orf68Q2NKX9 166 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF565Q8N9K5 539 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 Q8NFD4 153 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 OR13A1Q8NGR1 328 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 FBLIM1Q8WUP2 373 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF702PQ9H963 129 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 CALYQ9NYX4 217 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 MEGF11A6BM72 1044 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 MAGEA13PA6NCF6 341 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 LEUTXA8MZ59 168 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 H3BUI4 141 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 TSPAN15O95858 294 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 CELP19835 753 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 FSTP19883 344 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 ARHGDIBP52566 201 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 PRRX1P54821 245 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 RBM11P57052 281 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 SLC22A6Q4U2R8 563 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 JAGN1Q8N5M9 183 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 C11orf44Q8N8P7 122 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 SUMF2Q8NBJ7 301 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 MRGPRDQ8TDS7 321 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 TFAP2CQ92754 450 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF581Q9P0T4 197 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 ERGIC3Q9Y282 383 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 GPX5O75715 221 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 IGLV1-47P01700 117 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 BRS3P32247 399 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 CEACAM3P40198 252 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 LTC4SQ16873 150 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 HLA-DRB5Q30154 266 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 NHLRC3Q5JS37 347 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 ATAD3CQ5T2N8 411 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD1-209ENST00000557092 LINC00596Q86U02 117 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms