RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 EPPINO95925 133 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 HLA-GP17693 338 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 CSN1S1P47710 185 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 FBLN7Q53RD9 439 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 WFDC8Q8IUA0 241 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 MKXQ8IYA7 352 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 C17orf47Q8NEP4 570 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 GINS3Q9BRX5 216 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 TPPP3Q9BW30 176 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 RNF122Q9H9V4 155 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1W2PR77 199 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 HPRT1P00492 218 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 NXPH1P58417 271 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 OR8B8Q15620 311 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 OR8I2Q8N0Y5 310 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 ATOH7Q8N100 152 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 FABP2P12104 132 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 PNLIPRP2P54317 469 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 EMP1P54849 157 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 BTG2P78543 158 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 SLC36A2Q495M3 483 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 OR5D18Q8NGL1 313 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 RLN3Q8WXF3 142 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 PLEK2Q9NYT0 353 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 HLA-DQA1P01909 254 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 CNN1P51911 297 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 PMP22Q01453 160 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 DUSP2Q05923 314 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM251Q8N6I4 163 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 CCL4L1Q8NHW4 92 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 VSTM2LQ96N03 204 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 ICAM5Q9UMF0 924 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 FAM24AA6NFZ4 105 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 CST7O76096 145 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 CT45A6P0DMU7 189 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 CT45A5P0DMU8 189 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 CT45A7P0DMV0 189 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 G6PCP35575 357 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 PPICP45877 212 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM33P57088 247 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 CT45A1Q5HYN5 189 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 PYY3Q5JQD4 70 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 SLC25A26Q70HW3 274 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 OR2Y1Q8NGV0 311 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 CT45A3Q8NHU0 189 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 LIPHQ8WWY8 451 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 PP6455Q8WZ26 134 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 NMNAT3Q96T66 252 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 DUSP23Q9BVJ7 150 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1W2PQD3 144 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 C9orf170A2RU37 121 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 FRG2CA6NGY1 282 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 MKRN2OSH3BPM6 223 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 MMP23AO75900 390 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 IGHV2-70P01814 119 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 CLRN1P58418 232 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 CDC20BQ86Y33 519 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 TRAV39A0A0B4J263 110 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRD-214ENST00000540109 OR5AL1P0C617 328 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 GPR12P47775 334 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 SIRT6Q8N6T7 355 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 OR11L1Q8NGX0 322 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 TMED7Q9Y3B3 224 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 KCNE3Q9Y6H6 103 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1W2PPE3 182 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 ISLRO14498 428 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 ADRA2AP08913 450 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 HTR5AP47898 357 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-214ENST00000540109 GGTLC2Q14390 218 aa5.34□□□□□ -1.55
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