RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527006.1

TSTA3-205, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 412 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-205ENST00000527006 PYDC2Q56P42 97 aa11.93□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 PLAC9Q5JTB6 97 aa11.93□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 BRICD5Q6PL45 260 aa11.93□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 OR4S1Q8NGB4 309 aa11.93□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 CLDND2Q8NHS1 167 aa11.93□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 DMRTB1Q96MA1 342 aa11.93□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 Q96MF0 132 aa11.93□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 SULT4A1Q9BR01 284 aa11.93□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 SHARPINQ9H0F6 387 aa11.93□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 C12orf4Q9NQ89 552 aa11.93□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 AK3Q9UIJ7 227 aa11.93□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa11.93□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 AKAP6Q13023 2319 aa11.93□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 SPG11Q96JI7 2443 aa11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 MEIKINA0A087WXM9 373 aa11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 A0A1W2PPE2 198 aa11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 A0A1W2PR64 198 aa11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 A0A1W2PRV1 198 aa11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 CTDSPLO15194 276 aa11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 AMY2BP19961 511 aa11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 RBMXP38159 391 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 P2RX3P56373 397 aa11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 AESQ08117 197 aa11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 EDDM3AQ14507 147 aa11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 ZNF846Q147U1 533 aa11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 C6orf183Q5T699 404 aa11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 ZNF497Q6ZNH5 498 aa11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 MOB1BQ7L9L4 216 aa11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 SNX29P2Q8IUI4 249 aa11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 IZUMO1Q8IYV9 350 aa11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 TSC22D3Q99576 134 aa11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 REG4Q9BYZ8 158 aa11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 METRNQ9UJH8 293 aa11.92□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 LOC105371242A0A075B767 164 aa11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 A0A0G2JMP0 313 aa11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 A0A0X1KG70 313 aa11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 TMEM235A6NFC5 223 aa11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 RBBP9O75884 186 aa11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 HLA-DQB1P01920 261 aa11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 MT-ND4P03905 459 aa11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 LPLP06858 475 aa11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 LIPFP07098 398 aa11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 DTYMKP23919 212 aa11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 LMO4P61968 165 aa11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 RPL31P62899 125 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 ZNF554Q86TJ5 538 aa11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 BIVMQ86UB2 503 aa11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 GDPD1Q8N9F7 314 aa11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 DTX3Q8N9I9 347 aa11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 OR4M2Q8NGB6 313 aa11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 SOSTQ9BQB4 213 aa11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 IFT46Q9NQC8 304 aa11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 CTSZQ9UBR2 303 aa11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 ARID1AO14497 2285 aa11.91□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 HECTD1Q9ULT8 2610 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 APCP25054 2843 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 A0A1W2PQ09 198 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 ODAMA1E959 279 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 B4DSR2 109 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 GABARAPH6UMI1 98 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 TFF1P04155 84 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 GSTT2BP0CG30 244 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 KIR2DS4P43632 304 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 INPP1P49441 399 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 ACTBP60709 375 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 ACTG1P63261 375 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 KIR2DS1Q14954 304 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 ZNF841Q6ZN19 808 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 BTN2A1Q7KYR7 527 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 GAPTQ8N292 157 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 SETD6Q8TBK2 473 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 OCSTAMPQ9BR26 566 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 ING3Q9NXR8 418 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 TAS2R8Q9NYW2 309 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 UNC79Q9P2D8 2635 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 OPN4Q9UHM6 478 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 KCNK7Q9Y2U2 307 aa11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
TSTA3-205ENST00000527006 TACC2O95359 2948 aa11.89□□□□□ -0.51
TSTA3-205ENST00000527006 A8MXK9 166 aa11.89□□□□□ -0.51
TSTA3-205ENST00000527006 SPINT2O43291 252 aa11.89□□□□□ -0.51
TSTA3-205ENST00000527006 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms