RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIRREL3Q8IZU9 778 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SYCE1Q8N0S2 351 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 C1orf158Q8N1D5 194 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q8N6K4 173 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q8N814 137 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TCEANCQ8N8B7 351 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANKRD42Q8N9B4 389 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 POC1AQ8NBT0 407 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 C11orf65Q8NCR3 313 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR5T1Q8NG75 326 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR52L2PQ8NGH6 319 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR4A15Q8NGL6 344 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRGPRDQ8TDS7 321 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCARB1Q8WTV0 552 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PIGCQ92535 297 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 GTF2H4Q92759 462 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CMTM3Q96MX0 182 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 UHRF2Q96PU4 802 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR8B4Q96RC9 309 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FUZQ9BT04 418 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 UPK3BQ9BT76 320 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM43Q9BTV4 400 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PAXXQ9BUH6 204 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 HINT2Q9BX68 163 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANKRD60Q9BZ19 345 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHST6Q9GZX3 395 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 LACRTQ9GZZ8 138 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 GSTO2Q9H4Y5 243 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM38AQ9H6F2 299 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLSCR3Q9NRY6 295 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 COA4Q9NYJ1 87 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TAS2R5Q9NYW4 299 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TAS2R3Q9NYW6 316 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFNKQ9P0W0 207 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 VAX2Q9UIW0 290 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHMP2BQ9UQN3 213 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFT52Q9Y366 437 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MPC1Q9Y5U8 109 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNX5Q9Y5X3 404 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A087X0M5 115 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1B0GX30 115 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF732B4DXR9 585 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TAAR5O14804 337 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TSPAN4O14817 238 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MGST3O14880 152 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 S1PR2O95136 353 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHEK2O96017 543 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPS17P08708 135 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RBP1P09455 135 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 LAMP1P11279 417 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 EDN2P20800 178 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPRP35270 261 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAGEA3P43357 314 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR3A3P47888 321 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 IDH3AP50213 366 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 UGT2B15P54855 530 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDH12P55289 794 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 P2RX3P56373 397 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP10-8P60410 259 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL27P61353 136 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PAFAH1B2P68402 229 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP5G2Q06055 141 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FUT5Q11128 374 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRDX4Q13162 271 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OXA1LQ15070 435 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPA17Q15506 151 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP6AP1Q15904 470 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 C5orf64Q2M2E5 130 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PGS1Q32NB8 556 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNAI3Q3KNW1 292 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 GALNTL6Q49A17 601 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ALG10Q5BKT4 473 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM222AQ5U5X8 452 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 LIPMQ5VYY2 423 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR10K2Q6IF99 312 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 WDR73Q6P4I2 378 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 DNM1P34Q6PK57 102 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 DRAM2Q6UX65 266 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM131AQ6UXB0 335 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms