RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	SGCD	Q92629	289 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPER1	Q99527	375 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A087X0M5	115 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1B0GX30	115 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1W2PP11	408 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1W2PPK0	400 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM172BP	A6NC97	362 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAGEB3	O15480	346 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD1A	P06126	327 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	BDKRB2	P30411	391 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	GABRA5	P31644	462 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	AQP4	P55087	323 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC34A1	Q06495	639 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q6ZS46	218 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM219	Q86XT9	240 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYYR1	Q96J86	154 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	DERL3	Q96Q80	235 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR14A2	Q96R54	314 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	IFT22	Q9H7X7	185 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF702P	Q9H963	129 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	ING3	Q9NXR8	418 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIF25	Q9UIL4	384 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	NOTCH1	P46531	2555 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	FUOM	A2VDF0	154 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	LY6L	H3BQJ8	138 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	HTR3B	O95264	441 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDK1	P06493	297 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	WNT4	P56705	351 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP3R1	P63098	170 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	BDH1	Q02338	343 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	MED21	Q13503	144 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	RIPK1	Q13546	671 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	INSL4	Q14641	139 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	RSU1	Q15404	277 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNLS	Q5VYX0	342 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q8N2B8	174 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB18	Q9NP72	206 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	ING4	Q9UNL4	249 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SH3BP2-222	ENST00000512014	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	CEL	P19835	753 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	HTR1D	P28221	377 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAS2R43	P59537	309 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	IRF3	Q14653	427 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR52W1	Q6IF63	320 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	OSR2	Q8N2R0	312 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	STX19	Q8N4C7	294 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDNF	Q8TB73	568 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIRREL1	Q96J84	757 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR5M11	Q96RB7	305 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	METTL9	Q9H1A3	318 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	CALY	Q9NYX4	217 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	DPM3	Q9P2X0	92 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		10.19	□□□□□ -0.78

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