RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 SLAMF9Q96A28 289 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM265A0A087WTH1 108 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1W2PPE2 198 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 ADAM20O43506 726 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 CYTIPO60759 359 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 HAAOP46952 286 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 OR56B2PQ8NGI1 322 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 HLA-CQ95604 372 aa23.26■■□□□ 1.31
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SH3BP2-221ENST00000511747 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa23.26■■□□□ 1.31
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SH3BP2-221ENST00000511747 FAM90A18PA6NE21 464 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM90A16PA6NEW6 464 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM90A7PA6NKC0 464 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM90A22PA8MWA6 464 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM90A12PA8MX19 464 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa23.25■■□□□ 1.31
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SH3BP2-221ENST00000511747 S100A8P05109 93 aa23.25■■□□□ 1.31
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SH3BP2-221ENST00000511747 FAM90A13PP0C7W8 464 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM90A14PP0C7W9 464 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM90A24PP0C7X0 464 aa23.25■■□□□ 1.31
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SH3BP2-221ENST00000511747 SMDT1Q9H4I9 107 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
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SH3BP2-221ENST00000511747 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
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SH3BP2-221ENST00000511747 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa23.24■■□□□ 1.31
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SH3BP2-221ENST00000511747 IGKV1-13P0DP09 117 aa23.23■■□□□ 1.31
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SH3BP2-221ENST00000511747 HERPUD1Q15011 391 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 ACER2Q5QJU3 275 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC16A13Q7RTY0 426 aa23.23■■□□□ 1.31
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SH3BP2-221ENST00000511747 OR2B8PP59922 312 aa23.23■■□□□ 1.31
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SH3BP2-221ENST00000511747 CRIM1Q9NZV1 1036 aa23.23■■□□□ 1.31
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SH3BP2-221ENST00000511747 S100A9P06702 114 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF806P0C7X5 589 aa23.22■■□□□ 1.31
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SH3BP2-221ENST00000511747 PINLYPA6NC86 204 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 HSPA12AO43301 675 aa23.22■■□□□ 1.31
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SH3BP2-221ENST00000511747 C9orf135Q5VTT2 229 aa23.22■■□□□ 1.31
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SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM217Q8N7C4 229 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
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SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1W2PPZ6 126 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 PATE3B3GLJ2 98 aa23.21■■□□□ 1.31
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SH3BP2-221ENST00000511747 MTCH1Q9NZJ7 389 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 HSD17B6O14756 317 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 ARF1P84077 181 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 FOXO1Q12778 655 aa23.21■■□□□ 1.31
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SH3BP2-221ENST00000511747 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-221ENST00000511747 CLEC18AA5D8T8 446 aa23.2■■□□□ 1.3
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