RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 CEACAM19Q7Z692 300 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 MTURNQ8N3F0 131 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM104Q8NE00 496 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 OR5W2Q8NH69 310 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF563Q8TA94 476 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 CD300LFQ8TDQ1 290 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 GPR119Q8TDV5 335 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 TSPAN32Q96QS1 320 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 DERL2Q9GZP9 239 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 SPACA1Q9HBV2 294 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 EXD2Q9NVH0 621 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 GIN1Q9NXP7 522 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 IFNKQ9P0W0 207 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 ATPIF1Q9UII2 106 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 TFR2Q9UP52 801 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 RASD1Q9Y272 281 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
PDE4D-217ENST00000509355 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 A0A1B0GW55 424 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 A0A1W2PPE3 182 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 KCNK2O95069 426 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 IGHV1-69P01742 117 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 HLA-HP01893 362 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 FBP1P09467 338 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 DUX4L2P0CJ85 424 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 DUX4L3P0CJ86 424 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 DUX4L5P0CJ88 424 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 DUX4L6P0CJ89 424 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 DUX4L7P0CJ90 424 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 UMPSP11172 480 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 PRPS2P11908 318 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF35P13682 527 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 KITLGP21583 273 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 IVDP26440 423 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 STOMP27105 288 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 KIR2DS4P43632 304 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 CCNG1P51959 295 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 TAS2R39P59534 338 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 SLC35A1P78382 337 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 OR4D1Q15615 310 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 ECSCRQ19T08 205 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 SPANXN3Q5MJ09 141 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 DCST2Q5T1A1 773 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 CCNJQ5T5M9 372 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 OR2L13Q8N349 312 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 COX18Q8N8Q8 333 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 CDRT4Q8N9R6 151 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 PROKR2Q8NFJ6 384 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 OR8B3Q8NGG8 313 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 OR1B1Q8NGR6 318 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 CLHC1Q8NHS4 586 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 CDC26Q8NHZ8 85 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 NDNFQ8TB73 568 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 STAG3L4Q8TBR4 150 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 OR8B2Q96RD0 313 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 MBOAT4Q96T53 435 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 OSBPL10Q9BXB5 764 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 OR51B6Q9H340 312 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 IKZF5Q9H5V7 419 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 MIEF1Q9NQG6 463 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 ABCB10Q9NRK6 738 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM106BQ9NUM4 274 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 DUX4Q9UBX2 424 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 FLVCR2Q9UPI3 526 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 ACOT9Q9Y305 439 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 RNF11Q9Y3C5 154 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 PLXNB1O43157 2135 aa3.4□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 CEACAM18A8MTB9 384 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 FBP2O00757 339 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 AIM2O14862 343 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 TNFSF12O43508 249 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 ENSAO43768 121 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 SCN2BO60939 215 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM50AO95807 157 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 LY6G6CO95867 125 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 IGHV1-46P01743 117 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 THY1P04216 161 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 WNT2P09544 360 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms