RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MEIKINA0A087WXM9 373 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM90A22PA8MWA6 464 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FBXO24O75426 580 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CD24P25063 80 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEACAM3P40198 252 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MED21Q13503 144 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C1QL4Q86Z23 238 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LYG1Q8N1E2 194 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DHRSXQ8N5I4 330 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF565Q8N9K5 539 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR51T1Q8NGJ9 327 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM80Q96HE8 168 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM138Q9NPI0 162 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF25Q9UIL4 384 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF281Q9Y2X9 895 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAV24A0A0B4J272 114 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OGG1O15527 345 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDRT1O95170 752 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGLV1-47P01700 117 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ALDOBP05062 364 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CD34P28906 385 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GLP1RP43220 463 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR3A4PP47883 348 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IL13RA2Q14627 380 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C17orf58Q2M2W7 97 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PIGYQ3MUY2 71 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 Q6ZS46 218 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PACRGLQ8N7B6 248 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CAPSLQ8WWF8 208 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CREB3L1Q96BA8 519 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 S100A13Q99584 98 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C8orf4Q9NR00 106 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLEC2DQ9UHP7 191 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CD28P10747 220 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDI2Q5TDH0 399 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ASCL4Q6XD76 172 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMIM19Q96E16 107 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AKR1E2Q96JD6 320 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 METTL9Q9H1A3 318 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CSTBP04080 98 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BDKRB2P30411 391 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RCN1Q15293 331 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HLA-DRB5Q30154 266 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 Q8NFD4 153 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR13A1Q8NGR1 328 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR13C5Q8NGS8 318 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GHSRQ92847 366 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ORAI1Q96D31 301 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CALYQ9NYX4 217 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ST3GAL6Q9Y274 331 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A087X0M5 115 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A1B0GX30 115 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LALBAP00709 142 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C16orf82Q7Z2V1 217 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OSR2Q8N2R0 312 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR52N1Q8NH53 320 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR9G1Q8NH87 305 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GGHQ92820 318 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIRREL1Q96J84 757 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LIN7BQ9HAP6 207 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OPN1MWP04001 364 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OPN1MW2P0DN77 364 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OPN1MW3P0DN78 364 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CGB3P0DN86 165 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CGB7P0DN87 165 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MNDAP41218 407 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNJ3P48549 501 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ST3GAL4Q11206 333 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RIPK1Q13546 671 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LTC4SQ16873 150 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM95Q3KNT9 176 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UTF1Q5T230 341 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZFP41Q8N8Y5 198 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SUMF2Q8NBJ7 301 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRGPRDQ8TDS7 321 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WNT10AQ9GZT5 417 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CKLFQ9UBR5 152 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TGP01266 2768 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGHV3-7P01780 117 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SERPINA2P20848 420 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms