RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	PKIB	Q9C010	78 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLITRK2	Q9H156	845 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABCG5	Q9H222	651 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL36G	Q9NZH8	169 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	DUX4	Q9UBX2	424 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	USF3	Q68DE3	2245 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0G2JMP0	313 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0X1KG70	313 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	MEIOC	A2RUB1	952 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SSX5	O60225	188 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SELL	P14151	372 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARSB	P15848	533 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	MGMT	P16455	207 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDK2	P24941	298 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDKN1A	P38936	164 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	GMFB	P60983	142 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	BAK1	Q16611	211 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	AWAT2	Q6E213	333 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ELP2	Q6IA86	826 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM65	Q6PI78	240 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD177	Q8N6Q3	437 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	POC1A	Q8NBT0	407 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR8S1	Q8NH09	359 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	DYRK2	Q92630	601 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	MICU1	Q9BPX6	476 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TM2D1	Q9BX74	207 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRR	Q9GZT4	340 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	HMG20A	Q9NP66	347 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CKLF	Q9UBR5	152 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF222	Q9UK12	451 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM210	A6NLX4	147 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRRM5	B3KS81	715 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266		M0R233	179 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	APOA1	P02647	267 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SERPINA2	P20848	420 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHAT	P28329	748 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD80	P33681	288 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SOX6	P35712	828 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	MNDA	P41218	407 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	VEGFC	P49767	419 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSMD7	P51665	324 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAS2R20	P59543	309 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	FGF12	P61328	243 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TLE4	Q04727	773 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAF9	Q16594	264 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF573	Q86YE8	665 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRC29	Q8WV35	223 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ST8SIA4	Q92187	359 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTX4	Q96A99	478 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CEP19	Q96LK0	163 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TECTB	Q96PL2	329 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPER1	Q99527	375 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC22A4	Q9H015	551 aa		5.1	□□□□□ -1.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms