RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa22.24■■□□□ 1.15
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HOXB3-211ENST00000490677 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 OGG1O15527 345 aa22.23■■□□□ 1.15
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HOXB3-211ENST00000490677 AMY2AP04746 511 aa22.23■■□□□ 1.15
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HOXB3-211ENST00000490677 OR10K1Q8NGX5 313 aa22.23■■□□□ 1.15
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HOXB3-211ENST00000490677 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa22.22■■□□□ 1.15
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HOXB3-211ENST00000490677 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa22.22■■□□□ 1.15
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HOXB3-211ENST00000490677 ZNF485Q8NCK3 441 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-211ENST00000490677 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa22.22■■□□□ 1.15
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HOXB3-211ENST00000490677 OR4D6Q8NGJ1 314 aa22.21■■□□□ 1.15
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HOXB3-211ENST00000490677 CLEC2DQ9UHP7 191 aa22.21■■□□□ 1.15
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HOXB3-211ENST00000490677 CALYQ9NYX4 217 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-211ENST00000490677 IL36GQ9NZH8 169 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-211ENST00000490677 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa22.19■■□□□ 1.14
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HOXB3-211ENST00000490677 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
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HOXB3-211ENST00000490677 NHLRC3Q5JS37 347 aa22.19■■□□□ 1.14
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HOXB3-211ENST00000490677 TMEM138Q9NPI0 162 aa22.17■■□□□ 1.14
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HOXB3-211ENST00000490677 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-211ENST00000490677 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-211ENST00000490677 FAM90A12PA8MX19 464 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-211ENST00000490677 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-211ENST00000490677 OOSP1A8MZH6 123 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-211ENST00000490677 J3QR06 171 aa22.16■■□□□ 1.14
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HOXB3-211ENST00000490677 FAM90A15PP0C7V4 464 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-211ENST00000490677 FAM90A13PP0C7W8 464 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-211ENST00000490677 FAM90A14PP0C7W9 464 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-211ENST00000490677 FAM90A24PP0C7X0 464 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-211ENST00000490677 KCNJ3P48549 501 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-211ENST00000490677 DOC2BQ14184 412 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-211ENST00000490677 LRRC36Q1X8D7 754 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-211ENST00000490677 DDI2Q5TDH0 399 aa22.16■■□□□ 1.14
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