RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489554.1

SCAMP4-208, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SCAMP4, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-208ENST00000489554 UBBP0CG47 229 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 TMEM225BP0DP42 221 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 ARSBP15848 533 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 CD80P33681 288 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 CD276Q5ZPR3 534 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 PLET1Q6UQ28 207 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 GDPD3Q7L5L3 318 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 OR2W3Q7Z3T1 314 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 RTN4RL2Q86UN3 420 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 DUSP18Q8NEJ0 188 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 OR4M1Q8NGD0 313 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 OR10Z1Q8NGY1 313 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 FAM216AQ8WUB2 273 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 PTX4Q96A99 478 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 UPRTQ96BW1 309 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 SEH1LQ96EE3 360 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 Q96M66 194 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 WDR13Q9H1Z4 485 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 GHRLQ9UBU3 117 aa8.75□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 ADAM20O43506 726 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 LIPFP07098 398 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 TRAPPC2P0DI81 140 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 RAB6AP20340 208 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 ACTG1P63261 375 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 SLC22A6Q4U2R8 563 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 NHLRC3Q5JS37 347 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 TEX36Q5VZQ5 186 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 SIGIRRQ6IA17 410 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 MKXQ8IYA7 352 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 TOMM5Q8N4H5 51 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 OR51T1Q8NGJ9 327 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 LRRC29Q8WV35 223 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 FCAMRQ8WWV6 532 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 FAM46BQ96A09 425 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 NICN1Q9BSH3 213 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 TM2D1Q9BX74 207 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 METTL9Q9H1A3 318 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 BANF2Q9H503 90 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 TAS2R8Q9NYW2 309 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 ZNF69Q9UC07 566 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 TBC1D24Q9ULP9 559 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 ING4Q9UNL4 249 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa8.74□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 METTL21EPA6NDL7 271 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 GABARAPH6UMI1 98 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 LYRM1O43325 122 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 ORC5O43913 435 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 HTR3BO95264 441 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 MPIG6BO95866 241 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 GYPAP02724 150 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 MGMTP16455 207 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 AMY2BP19961 511 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 SERPINA2P20848 420 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 FAUP35544 74 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 RBM11P57052 281 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 FGF12P61328 243 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 DYRK1AQ13627 763 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 RSU1Q15404 277 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 MICBQ29980 383 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 PIGYQ3MUY2 71 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 MOGAT2Q3SYC2 334 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 RAB12Q6IQ22 244 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 C12orf54Q6X4T0 127 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 ACP7Q6ZNF0 438 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 FAM90A1Q86YD7 464 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 CMTM4Q8IZR5 234 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 FAM89BQ8N5H3 189 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 ZDHHC22Q8N966 263 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 KCNG3Q8TAE7 436 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 RHBDL2Q9NX52 303 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 CTSZQ9UBR2 303 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 ZNF222Q9UK12 451 aa8.73□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa8.72□□□□□ -1.01
SCAMP4-208ENST00000489554 C22orf46C9J442 243 aa8.72□□□□□ -1.01
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