RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 BCHEP06276 602 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ANXA5P08758 320 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF250P15622 560 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 UGT2B10P36537 528 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 CD79BP40259 229 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 CSNK1A1P48729 337 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 TMED10P49755 219 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 TBPL1P62380 186 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 REEP5Q00765 189 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 PLGLB1Q02325 96 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 RELAQ04206 551 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 MXD1Q05195 221 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 SYCNQ0VAF6 134 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 PDK2Q15119 407 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 EBPQ15125 230 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 RGNQ15493 299 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ABCA11PQ4W5N1 156 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC122Q5T0U0 273 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 NCMAPQ5T1S8 102 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 CCNJQ5T5M9 372 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKRD22Q5VYY1 191 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 NANOGP8Q6NSW7 305 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 PID1Q7Z2X4 250 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 RIMKLAQ8IXN7 391 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ZFP41Q8N8Y5 198 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 OR5M1Q8NGP8 315 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 OR10J6PQ8NGY7 276 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ACTL9Q8TC94 416 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 NT5CQ8TCD5 201 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 TM4SF18Q96CE8 201 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 TPD52L3Q96J77 140 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 CHP1Q99653 195 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC29A1Q99808 456 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 CENPKQ9BS16 269 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC25A2Q9BXI2 301 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKRA2Q9H9E1 313 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 C12orf10Q9HB07 376 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 LRTM1Q9HBL6 345 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 UVRAGQ9P2Y5 699 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 OPN4Q9UHM6 478 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 C15orf41Q9Y2V0 281 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 KMT2AQ03164 3969 aa1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 GOLGA8OA6NCC3 632 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF716A6NP11 495 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 E7EQL1 145 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 GOLGA8NF8WBI6 632 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 GOLGA8RI6L899 631 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 SNX4O95219 450 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 HLA-DPB1P04440 258 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 GYPCP04921 128 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 UQCRHP07919 91 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ADRA2AP08913 450 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF735P0CB33 412 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 IGHV1-8P0DP01 117 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF708P17019 499 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 CMPK1P30085 196 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ESRRGP62508 458 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 C5orf47Q569G3 176 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXO48Q5FWF7 155 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ARL9Q6T311 187 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 PLET1Q6UQ28 207 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 NPSR1Q6W5P4 371 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 RTL4Q6ZR62 310 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 CPNE9Q8IYJ1 553 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF561Q8N587 486 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM156Q8N614 296 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 PRELID2Q8N945 189 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 NOXO1Q8NFA2 376 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 CD200R1Q8TD46 325 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ABHD3Q8WU67 409 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 RAD51AP1Q96B01 352 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 MS4A6EQ96DS6 147 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 DCUN1D1Q96GG9 259 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 RILPQ96NA2 401 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 OR5B12Q96R08 314 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 SFXN3Q9BWM7 321 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 SIRT7Q9NRC8 400 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 CHRAC1Q9NRG0 131 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC22A7Q9Y694 548 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 IKBKGQ9Y6K9 419 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 TANC2Q9HCD6 1990 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 STAB2Q8WWQ8 2551 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 PKD1P98161 4303 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms