RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 CLN3Q13286 438 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 ST8SIA1Q92185 356 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 DYRK2Q92630 601 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 SYT3Q9BQG1 590 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 NKX2-6A6NCS4 301 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 IL18BPO95998 194 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 CD55P08174 381 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 ZNF17P17021 662 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 DYNLT3P51808 116 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 ERVS71-1P61550 626 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 ADIRFQ15847 76 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 GPR137CQ8N3F9 429 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 FAM89BQ8N5H3 189 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 DNASE2BQ8WZ79 361 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 VSTM2BA6NLU5 285 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 HLA-HP01893 362 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 CELA2AP08217 269 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 PAX1P15863 534 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 ZP4Q12836 540 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 P2RY6Q15077 328 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 SLC16A14Q7RTX9 510 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 CARFQ8N187 725 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 DDIT4LQ96D03 193 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 PGAM5Q96HS1 289 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 NECAP2Q9NVZ3 263 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 F5H5K5 113 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 TGOLN2O43493 480 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 ANGPTL7O43827 346 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 FAHP16930 419 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 CEACAM6P40199 344 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 GABREP78334 506 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 CCL7P80098 99 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 BATFQ16520 125 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 PRAMEF20Q5VT98 475 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 CALHM2Q9HA72 323 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 GPR173Q9NS66 373 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 A0A1B0GU03 582 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 A6NNC1 897 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 HBE1P02100 147 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 OPN1MWP04001 364 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 OPN1MW2P0DN77 364 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 OPN1MW3P0DN78 364 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 CLRN1P58418 232 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 PLPPR5Q32ZL2 321 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 SPIN3Q5JUX0 258 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 TMEM252Q8N6L7 170 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 LHFPL6Q9Y693 200 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 MARCH11A6NNE9 402 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 PPP5D1E7EU14 171 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 GCGP01275 180 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 ZNF43P17038 809 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 NCR3LG1Q68D85 454 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 KMT5CQ86Y97 462 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 ZNF665Q9H7R5 613 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 METTL7AQ9H8H3 244 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 U3KQA8 63 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 C5orf63A6NC05 138 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 RAB4AP20338 218 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 ZNF154Q13106 437 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 DOK3Q7L591 496 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 PCED1AQ9H1Q7 454 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 ZNF581Q9P0T4 197 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 MYOTQ9UBF9 498 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 CEBPZOSA8MTT3 80 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 H3BP45 60 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 K7ESF4 209 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 NPSP0C0P6 89 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 EPHA1P21709 976 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 NUBP1P53384 320 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 HERV-K104P61576 105 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 ZNF695Q8IW36 515 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 TMEM18Q96B42 140 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 GPHA2Q96T91 129 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 TMEM208Q9BTX3 173 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 A0A1W2PPQ1 181 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 MSTNO14793 375 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 PDCD1Q15116 288 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 TEX38Q6PEX7 206 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 RABEPKQ7Z6M1 372 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-212ENST00000488380 SPEM1Q8N4L4 309 aa11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms