RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 RNF7Q9UBF6 113 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 SLC38A11Q08AI6 406 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 MPV17LQ2QL34 196 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 KCNE5Q9UJ90 142 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 HAND1O96004 215 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 FBP1P09467 338 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF250P15622 560 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 ZP4Q12836 540 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 TEX261Q6UWH6 196 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 BTNL8Q6UX41 500 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 FAM181AQ8N9Y4 354 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 DUSP18Q8NEJ0 188 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 CTHRC1Q96CG8 243 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 TGIF2Q9GZN2 237 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 U3KQ87 197 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 KIF26BQ2KJY2 2108 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 LNP1A1A4G5 178 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 AKR1C3P42330 323 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 MISP3Q96FF7 219 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1W2PPQ1 181 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 TRDCB7Z8K6 153 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 CHEK1O14757 476 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 PPYP01298 95 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 VDAC1P21796 283 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 LIMS1P48059 325 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 CCL8P80075 99 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 RTP5Q14D33 572 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 PIGYQ3MUY2 71 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 SPINK9Q5DT21 86 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM88Q6PEY1 159 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 SLC23A3Q6PIS1 610 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 OR5M8Q8NGP6 311 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 NTNG2Q96CW9 530 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 RHOFQ9HBH0 211 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 CYTIPO60759 359 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 PSG4Q00888 419 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 PLAC9Q5JTB6 97 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 TXN2Q99757 166 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 MUC6Q6W4X9 2439 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 LANCL1O43813 399 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 NCR3LG1Q68D85 454 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 LIAT1Q6ZQX7 453 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF441Q8N8Z8 693 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 OR13D1Q8NGV5 346 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 OR4S2Q8NH73 311 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 ADIPOR1Q96A54 375 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 ADTRPQ96IZ2 230 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 TOX4O94842 621 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 TIAF1O95411 115 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 FGF2P09038 288 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 BCL3P20749 454 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 ACSM6Q6P461 480 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 MS4A3Q96HJ5 214 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 THYN1Q9P016 225 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 TIMM9Q9Y5J7 89 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1W2PN81 502 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 LY86O95711 162 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 CHRNA7P36544 502 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 P2RY6Q15077 328 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 CDCP2Q5VXM1 449 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 OR1A1Q9P1Q5 309 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF785A8K8V0 405 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 PLA2G10O15496 165 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 CA11O75493 328 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 Q56UQ5 140 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 PRSS54Q6PEW0 395 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 BTNL3Q6UXE8 466 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 CLEC18BQ6UXF7 455 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 CCL28Q9NRJ3 127 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 PRR13Q9NZ81 148 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 CTRB1P17538 263 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 NTF3P20783 257 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 MPPED2Q15777 294 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 MIDNQ504T8 468 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 CTRB2Q6GPI1 263 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 ZBTB44Q8NCP5 570 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 VSTM2AQ8TAG5 236 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 AMELYQ99218 206 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 OR51I2Q9H344 312 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 FBXL17Q9UF56 701 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 ADAM10O14672 748 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 CTDSPLO15194 276 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 CRYBA1P05813 215 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 CNN1P51911 297 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 EFNB2P52799 333 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 PJVKQ0ZLH3 352 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 FFAR4Q5NUL3 377 aa11.67□□□□□ -0.54
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