RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 MOB3BQ86TA1 216 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 SNX22Q96L94 193 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 CCL13Q99616 98 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 DKK4Q9UBT3 224 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 V9GYH0 126 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 DEFB108AA8MXU0 73 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 PMELP40967 661 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 ATP5J2P56134 94 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 C4orf17Q53FE4 359 aa7.09□□□□□ -1.27
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PTPRD-211ENST00000486161 OR10Z1Q8NGY1 313 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 CEP192Q8TEP8 1941 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 OR2H2O95918 312 aa7.09□□□□□ -1.27
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PTPRD-211ENST00000486161 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
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PTPRD-211ENST00000486161 AESQ08117 197 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 S100A7AQ86SG5 101 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.09□□□□□ -1.27
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PTPRD-211ENST00000486161 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.09□□□□□ -1.27
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PTPRD-211ENST00000486161 CEBPGP53567 150 aa7.09□□□□□ -1.27
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PTPRD-211ENST00000486161 FGFBP3Q8TAT2 258 aa7.09□□□□□ -1.27
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PTPRD-211ENST00000486161 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 A0A0D9SG52 128 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 HRASP01112 189 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7.09□□□□□ -1.27
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PTPRD-211ENST00000486161 SSX9Q7RTT3 188 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 HOGA1Q86XE5 327 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 CCL19Q99731 98 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-211ENST00000486161 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa7.08□□□□□ -1.28
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PTPRD-211ENST00000486161 OCEL1Q9H607 264 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 FREM3P0C091 2139 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 GIPP09681 153 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
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PTPRD-211ENST00000486161 TPT1P13693 172 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 S100A7P31151 101 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF154Q13106 437 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 AKIRIN2Q53H80 203 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
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PTPRD-211ENST00000486161 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 CITED4Q96RK1 184 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 SHARPINQ9H0F6 387 aa7.08□□□□□ -1.28
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PTPRD-211ENST00000486161 MIOXQ9UGB7 285 aa7.08□□□□□ -1.28
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PTPRD-211ENST00000486161 Q3ZCU0 254 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 SHEQ5VZ18 495 aa7.08□□□□□ -1.28
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PTPRD-211ENST00000486161 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 PRR32B1ATL7 298 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 TSPAN9O75954 239 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 KIR2DS2P43631 304 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 PLA2G7Q13093 441 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 ASB13Q8WXK3 278 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 Q96M66 194 aa7.08□□□□□ -1.28
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