RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 C9orf152Q5JTZ5 239 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 LPCAT4Q643R3 524 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 CCDC121Q6ZUS5 278 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 OR9G1Q8NH87 305 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 RPEQ96AT9 228 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 COQ2Q96H96 371 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 AMBNQ9NP70 447 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 NOTCH1P46531 2555 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 H3BNX3 289 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 CLIC3O95833 236 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 PF4P02776 101 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 CD2P06729 351 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 GDNFP39905 211 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 ZP1P60852 638 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 RSU1Q15404 277 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 RNF144BQ7Z419 303 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 PXT1Q8NFP0 134 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 TOMM40LQ969M1 308 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 TGP01266 2768 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 A0A087X0M5 115 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 A0A1B0GX30 115 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 GABRB1P18505 474 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 CD83Q01151 205 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 CDK5R1Q15078 307 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 ZSCAN26Q16670 478 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 RHOXF1Q8NHV9 184 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 S100A13Q99584 98 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 SOX2P48431 317 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 KCNJ3P48549 501 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 IL13RA2Q14627 380 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 C17orf58Q2M2W7 97 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 ELP2Q6IA86 826 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 ZNF555Q8NEP9 628 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 OR51T1Q8NGJ9 327 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 OR52I1Q8NGK6 324 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 CNIH3Q8TBE1 160 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 CALYQ9NYX4 217 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 KIF25Q9UIL4 384 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 E9PI62 339 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 E9PQ18 207 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 HTR3BO95264 441 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 LOXL3P58215 753 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 PPP3R1P63098 170 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 HES1Q14469 280 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 LTC4SQ16873 150 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 GPR148Q8TDV2 347 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 PHF21AQ96BD5 680 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 KIRREL1Q96J84 757 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 FAM118AQ9NWS6 357 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 ING4Q9UNL4 249 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 MOB4Q9Y3A3 225 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-212ENST00000484841 J3QR06 171 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 GABRPO00591 440 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 CSTBP04080 98 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 SLC35A2P78381 396 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 Q6ZPA2 131 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 MYDGFQ969H8 173 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 JAM3Q9BX67 310 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 TAS2R4Q9NYW5 299 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 IRGMA1A4Y4 181 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 LY6LH3BQJ8 138 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 IL1AP01583 271 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 IGLL1P15814 213 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 GNG10P50151 68 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 MADCAM1Q13477 382 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 CCDC58Q4VC31 144 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 THNSL2Q86YJ6 484 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 OR13A1Q8NGR1 328 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 OR10K1Q8NGX5 313 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 OR10X1Q8NGY0 326 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 MRGPRDQ8TDS7 321 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 METTL9Q9H1A3 318 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 S100A14Q9HCY8 104 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 TRAV24A0A0B4J272 114 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 IGHV3-7P01780 117 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 RAB7AP51149 207 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 FOXB2Q5VYV0 432 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 OSR2Q8N2R0 312 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-212ENST00000484841 OR10A7Q8NGE5 316 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms