RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482651.5

HDGF-208, Transcript of heparin binding growth factor, human

TSL 3

Gene HDGF, Length 966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDGF-208	ENST00000482651	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	SNAPC5	O75971	98 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	PNP	P00491	289 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	TTR	P02766	147 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	ZP3	P21754	424 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	FAM3A	P98173	230 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	CDK5R1	Q15078	307 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	OR8G1	Q15617	311 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	WDR38	Q5JTN6	314 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	TEX29	Q8N6K0	151 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651		Q8NFD4	153 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	OR8S1	Q8NH09	359 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	PP6455	Q8WZ26	134 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	PHF21A	Q96BD5	680 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	MICU1	Q9BPX6	476 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	PPA2	Q9H2U2	334 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	NUDT15	Q9NV35	164 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	CKLF	Q9UBR5	152 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	DHDH	Q9UQ10	334 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	7.34	□□□□□ -1.23	4e-9	■■■□□ 16.7
HDGF-208	ENST00000482651	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651		H0YL77	283 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	TMEM178B	H3BS89	294 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651		J3QLI3	93 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	TCF21	O43680	179 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	PRAF2	O60831	178 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	TSPAN9	O75954	239 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	CST4	P01036	141 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	CCL1	P22362	96 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	GATA3	P23771	443 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	PITPNA	Q00169	270 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	SCGB2A2	Q13296	93 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	OR8B8	Q15620	311 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	ODF4	Q2M2E3	257 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	SPIC	Q8N5J4	248 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	OR56B4	Q8NH76	319 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	GHSR	Q92847	366 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	GCM1	Q9NP62	436 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651		V9GYS6	101 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDGF-208	ENST00000482651	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDGF-208	ENST00000482651	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDGF-208	ENST00000482651	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDGF-208	ENST00000482651		E9PI62	339 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDGF-208	ENST00000482651	PPIAL4D	F5H284	164 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDGF-208	ENST00000482651		F5H5P2	479 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDGF-208	ENST00000482651	MLNR	O43193	412 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDGF-208	ENST00000482651	NDUFA2	O43678	99 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDGF-208	ENST00000482651	FOXH1	O75593	365 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDGF-208	ENST00000482651	B3GALNT1	O75752	331 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDGF-208	ENST00000482651	ZFPL1	O95159	310 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDGF-208	ENST00000482651	NRAS	P01111	189 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDGF-208	ENST00000482651	IGLV3-1	P01715	115 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDGF-208	ENST00000482651	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDGF-208	ENST00000482651	IRF2	P14316	349 aa		7.33	□□□□□ -1.24

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