RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479566.5

PRKCZ-216, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 3

Gene PRKCZ, Length 501 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-216	ENST00000479566	FBXO24	O75426	580 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	BDKRB2	P30411	391 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	RAB13	P51153	203 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	EDDM3B	P56851	147 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	FAM189A2	Q15884	450 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	DDI2	Q5TDH0	399 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	ZNF626	Q68DY1	528 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	SATL1	Q86VE3	508 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	OR8H2	Q8N162	312 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	GLS2	Q9UI32	602 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	TMEM82	A0PJX8	343 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	ZNF728	P0DKX0	622 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	CALCB	P10092	127 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	DUSP1	P28562	367 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	MTNR1B	P49286	362 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	EDDM3A	Q14507	147 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	SSX2	Q16385	188 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566		Q8N2B8	174 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	SNX22	Q96L94	193 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566		A6NDX4	124 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	RBP4	P02753	201 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	CD28	P10747	220 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	OR3A4P	P47883	348 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	GPR50	Q13585	617 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	ELP2	Q6IA86	826 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	UFD1	Q92890	307 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRKCZ-216	ENST00000479566		A0A1W2PPK0	400 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	SIRPB1	O00241	398 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	SH2D1B	O14796	132 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	PIN1P1	O15428	100 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	PSPN	O60542	156 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	OR2H2	O95918	312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	GABRR1	P24046	479 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	PTGFR	P43088	359 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	GABARAPL2	P60520	117 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	RSU1	Q15404	277 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	GRK1	Q15835	563 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	ASCL4	Q6XD76	172 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566		Q6ZPA2	131 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	ZNF714	Q96N38	554 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	TMED9	Q9BVK6	235 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	CHST6	Q9GZX3	395 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	IL36G	Q9NZH8	169 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	SC5D	O75845	299 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	HSMCR30	P0CW71	290 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	ZNF44	P15621	663 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	LMO1	P25800	156 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	OR3A1	P47881	315 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566		Q6ZS46	218 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	DTX3	Q8N9I9	347 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	CHST4	Q8NCG5	386 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566		Q8NFD4	153 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	MALSU1	Q96EH3	234 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	MMP28	Q9H239	520 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	F2RL2	O00254	374 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	MGST3	O14880	152 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	CDRT1	O95170	752 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	MAS1	P04201	325 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	MAP2K4	P45985	399 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	TPBG	Q13641	420 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	IL13RA2	Q14627	380 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	INSL4	Q14641	139 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566		Q6P435	159 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRKCZ-216	ENST00000479566	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		13.56	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms