RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 ASB13Q8WXK3 278 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM114B3SHH9 223 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 LGALS9O00182 355 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 IFNA6P05013 189 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 SOD3P08294 240 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 CFL1P23528 166 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 IMPA1P29218 277 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 AGTR1P30556 359 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 IDH2P48735 452 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 RAP1GDS1P52306 607 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 TAS2R43P59537 309 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 CLEC20AQ6ZU45 233 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 OR5H2Q8NGV7 314 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC37A2Q8TED4 501 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 TBL1YQ9BQ87 522 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 ENOPH1Q9UHY7 261 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 POMPQ9Y244 141 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 MIA3Q5JRA6 1907 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 MEGF6O75095 1541 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 ACOX3O15254 700 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 TCF21O43680 179 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 ARL6IP5O75915 188 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV1-39P01597 117 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV1D-39P04432 117 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 EVI2BP34910 448 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 CXCL12P48061 93 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 CDC20Q12834 499 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP1R1AQ13522 171 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 C1DQ13901 141 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF684Q5T5D7 378 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 SYPL2Q5VXT5 272 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 ZDHHC22Q8N966 263 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2Z1Q8NG97 314 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 OR11L1Q8NGX0 322 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 TAMM41Q96BW9 452 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 NDFIP1Q9BT67 221 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 MROQ9BYG7 248 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC22A13Q9Y226 551 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 BTRCQ9Y297 605 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 AGRNO00468 2067 aa3.96□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 DCTN3O75935 186 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 HLA-DQB1P01920 261 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 SEC11BP0C7V7 166 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 NELFEP18615 380 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL12P30050 165 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP5G2Q06055 141 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 SKP2Q13309 424 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 CENPWQ5EE01 88 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFP1Q6P2D0 407 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 UBALD2Q8IYN6 164 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 CLDN23Q96B33 292 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 OTUB2Q96DC9 234 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 OLFM3Q96PB7 478 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 DERL3Q96Q80 235 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 ULBP1Q9BZM6 244 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 BCL2L14Q9BZR8 327 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 C21orf62Q9NYP8 219 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 TAC3Q9UHF0 121 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 ALG5Q9Y673 324 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 PINLYPA6NC86 204 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 A8MWL6 223 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 SULT1B1O43704 296 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00614P0C842 121 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC6A1P30531 599 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 OPRK1P41145 380 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 HSPA13P48723 471 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 MP68P56378 58 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 FMODQ06828 376 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM241Q24JQ0 296 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 LUZP6Q538Z0 58 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 TTMPQ5BVD1 217 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 MKXQ8IYA7 352 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 STK40Q8N2I9 435 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC01560Q8TB33 94 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms