RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466832.5

TRA2B-209, Transcript of transformer 2 beta homolog, human

TSL 2

Gene TRA2B, Length 2,414 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRA2B-209	ENST00000466832	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TRA2B-209	ENST00000466832	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TRA2B-209	ENST00000466832	OR2M7	Q8NG81	312 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TRA2B-209	ENST00000466832	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TRA2B-209	ENST00000466832	PSMF1	Q92530	271 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TRA2B-209	ENST00000466832	CMBL	Q96DG6	245 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TRA2B-209	ENST00000466832	BORCS8	Q96FH0	119 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TRA2B-209	ENST00000466832	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TRA2B-209	ENST00000466832	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TRA2B-209	ENST00000466832	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
TRA2B-209	ENST00000466832	GLRX2	Q9NS18	164 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TRA2B-209	ENST00000466832	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
TRA2B-209	ENST00000466832	ZNF175	Q9Y473	711 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TRA2B-209	ENST00000466832	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SEC16A	O15027	2179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832		F5H5K5	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832		H3BSH0	61 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	PDCD6	O75340	191 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	CTXN2	P0C2S0	81 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ZNF32	P17041	273 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TCN2	P20062	427 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TUBG1	P23258	451 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	UQCRFS1	P47985	274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	LHX2	P50458	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	MTCP1	P56278	107 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	FAM3A	P98173	230 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	PSG4	Q00888	419 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	RSU1	Q15404	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	OR52W1	Q6IF63	320 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	OSR2	Q8N2R0	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	LRRC18	Q8N456	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	COMMD1	Q8N668	190 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	EHF	Q9NZC4	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	LRP5L	A4QPB2	252 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	MPTX1	A8MV57	137 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	CXCL13	O43927	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	NME2P1	O60361	137 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	IFNA21	P01568	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	FCGR3A	P08637	254 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SLC2A1	P11166	492 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	CD79A	P11912	226 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	MMP9	P14780	707 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	KLK2	P20151	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	GDF1	P27539	372 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	OTX2	P32243	289 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	HTR5A	P47898	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	STAR	P49675	285 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	CLDN18	P56856	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	KLRB1	Q12918	225 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SYT3	Q9BQG1	590 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	PKIB	Q9C010	78 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	BANF2	Q9H503	90 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	CRLF2	Q9HC73	371 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	MBD2	Q9UBB5	411 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ACAN	P16112	2415 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	C5orf51	A6NDU8	294 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	OR5B21	A6NL26	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832		E9PLN8	166 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832		H7C1Q1	480 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	GRP	P07492	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	EGR1	P18146	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SERPINA2	P20848	420 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	MEOX1	P50221	254 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	VAMP2	P63027	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SHE	Q5VZ18	495 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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