RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 AMDHD2Q9Y303 409 aa7.33□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 ZNF175Q9Y473 711 aa7.33□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.33□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 FRYLO94915 3013 aa7.33□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 MSGN1A6NI15 193 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 TUSC2O75896 110 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 IGKV1D-12P01611 117 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 OR5AC1P0C628 307 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 DANCRP0C864 163 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 SPP1P10451 314 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 EDN3P14138 238 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 SELEP16581 610 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 SPINK2P20155 84 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 VDAC1P21796 283 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 OPRM1P35372 400 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 CD200P41217 278 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 KCNJ3P48549 501 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 RRADP55042 308 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 RAB2AP61019 212 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 RAB1AP62820 205 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 PLGLB1Q02325 96 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 TGFBR3Q03167 851 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 HGFACQ04756 655 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 OR1C1Q15619 314 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 MST1LQ2TV78 715 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 DCAF10Q5QP82 559 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 OR4A4PQ8NGN8 299 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 TOMM40LQ969M1 308 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 FBXL17Q9UF56 701 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 A0A1B0GU03 582 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 C5orf49A4QMS7 147 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 TMEM8BA6NDV4 472 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 CD300LBA8K4G0 201 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 NME2P1O60361 137 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 SP1P08047 785 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 NME2P22392 152 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 AADACP22760 399 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 ANOS1P23352 680 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 UCP1P25874 307 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 PRSS12P56730 875 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 VAMP2P63027 116 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 PIGYQ3MUY2 71 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 RNF212Q495C1 297 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 SPINK14Q6IE38 97 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 DTX1Q86Y01 620 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 OR2C3Q8N628 320 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 TMEM178AQ8NBL3 297 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 OR56B2PQ8NGI1 322 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 ABHD3Q8WU67 409 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 MAFIPQ8WZ33 124 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 BOD1Q96IK1 185 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 KIRREL1Q96J84 757 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 POM121L2Q96KW2 1035 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 TTTY12Q9BZ98 90 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 HRH4Q9H3N8 390 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 MLXQ9UH92 298 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 A0A0G2JMM0 328 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PPB8 328 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PRS3 328 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 RNF212BA8MTL3 300 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 KIR3DP1A8MWS1 328 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 ZNF732B4DXR9 585 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 H0Y980 276 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 DEGS1O15121 323 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 DFFBO76075 338 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 LY86O95711 162 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 FOLR2P14207 255 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 ITGA3P26006 1051 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 GNRHRP30968 328 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 HAAOP46952 286 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 CAMLGP49069 296 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 FXYD4P59646 89 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 RPS18P62269 152 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 ID3Q02535 119 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 CLN3Q13286 438 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-208ENST00000464611 TSC22D1Q15714 1073 aa7.3□□□□□ -1.24
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