RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 CRYABP02511 175 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
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PTPRC-210ENST00000462363 GLI4P10075 376 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF250P15622 560 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 SELEP16581 610 aa4.78□□□□□ -1.64
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PTPRC-210ENST00000462363 LMO1P25800 156 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 CCKARP32238 428 aa4.78□□□□□ -1.64
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PTPRC-210ENST00000462363 C5orf24Q7Z6I8 188 aa4.78□□□□□ -1.64
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PTPRC-210ENST00000462363 SCCPDHQ8NBX0 429 aa4.78□□□□□ -1.64
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PTPRC-210ENST00000462363 OR8H1Q8NGG4 311 aa4.78□□□□□ -1.64
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PTPRC-210ENST00000462363 C18orf12Q96KH6 178 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 OR10C1Q96KK4 312 aa4.78□□□□□ -1.64
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PTPRC-210ENST00000462363 RTL8AQ9BWD3 113 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 REG4Q9BYZ8 158 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-210ENST00000462363 TOLLIPQ9H0E2 274 aa4.78□□□□□ -1.64
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PTPRC-210ENST00000462363 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
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PTPRC-210ENST00000462363 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF585AQ6P3V2 769 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRC-210ENST00000462363 GSG1LQ6UXU4 331 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRC-210ENST00000462363 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 C22orf34Q6ZV56 151 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 SLC51BQ86UW2 128 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 DOLPP1Q86YN1 238 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 Q8IYB0 196 aa4.77□□□□□ -1.65
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