RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434424.5

PTPRK-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-212ENST00000434424 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 TNFRSF19Q9NS68 423 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 SLC7A10Q9NS82 523 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 ITPR3Q14573 2671 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 ITPR2Q14571 2701 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 TRAV17A0A0B4J275 112 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 ENSAO43768 121 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 PTHP01270 115 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 CTRLP40313 264 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 RBM34P42696 430 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 CA7P43166 264 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 MLF1P58340 268 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 TPI1P60174 286 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 DSTNP60981 165 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 CACNG7P62955 275 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 PSG5Q15238 335 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 RGNQ15493 299 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 TMEM183BQ1AE95 376 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 HES5Q5TA89 166 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 DNAJC24Q6P3W2 148 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 TMEM183AQ8IXX5 376 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 COX18Q8N8Q8 333 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 LRRC45Q96CN5 670 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 PLEKHA1Q9HB21 404 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 SLC40A1Q9NP59 571 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 ACOT9Q9Y305 439 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 PLAC8L1A1L4L8 177 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 HDAC3O15379 428 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 UPK1BO75841 260 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 LOXP28300 417 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 CA5AP35218 305 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 UGT2B10P36537 528 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 NMUP48645 174 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 RGS6P49758 472 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 TSPAN5P62079 268 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRK-212ENST00000434424 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRK-212ENST00000434424 MAT2BQ9NZL9 334 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRK-212ENST00000434424 BTRCQ9Y297 605 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRK-212ENST00000434424 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRK-212ENST00000434424 IGLV2-23P01705 113 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 OR5AL1P0C617 328 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 OMGP23515 440 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 SLC35A1P78382 337 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 OR4D1Q15615 310 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF774Q6NX45 483 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 PRSS58Q8IYP2 241 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 OR2Y1Q8NGV0 311 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 DOK4Q8TEW6 326 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 FAM172AQ8WUF8 416 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRK-212ENST00000434424 SPNS1Q9H2V7 528 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 OR51B5Q9H339 312 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 TMBIM4Q9HC24 238 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRK-212ENST00000434424 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 SDK2Q58EX2 2172 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRK-212ENST00000434424 A0A0J9YXV3 536 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 OR2B3O76000 313 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 GAS8-AS1O95177 125 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 BRI3O95415 125 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 SOD1P00441 154 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 HTR1DP28221 377 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 GGT2P36268 569 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 MAGEA6P43360 314 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 NDUFA8P51970 172 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 SLAMF1Q13291 335 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-212ENST00000434424 EXOC3L4Q17RC7 722 aa5.03□□□□□ -1.6
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