RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 M0QZ24 198 aa13.15□□□□□ -0.3
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCNJ3P48549 501 aa13.15□□□□□ -0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PIGYQ3MUY2 71 aa13.15□□□□□ -0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC35E4Q6ICL7 350 aa13.15□□□□□ -0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ABHD12Q8N2K0 398 aa13.15□□□□□ -0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR51T1Q8NGJ9 327 aa13.15□□□□□ -0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CORO2AQ92828 525 aa13.15□□□□□ -0.3
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 MND1Q9BWT6 205 aa13.15□□□□□ -0.3
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 TCF7L1Q9HCS4 588 aa13.15□□□□□ -0.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 FSTP19883 344 aa13.14□□□□□ -0.31
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 AQP4P55087 323 aa13.14□□□□□ -0.31
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC22A6Q4U2R8 563 aa13.14□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LAIR2Q6ISS4 152 aa13.14□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C11orf88Q6PI97 169 aa13.14□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LINC00596Q86U02 117 aa13.14□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NANOGP1Q8N7R0 232 aa13.14□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF485Q8NCK3 441 aa13.14□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NEK7Q8TDX7 302 aa13.14□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CAPSLQ8WWF8 208 aa13.14□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CREB3L1Q96BA8 519 aa13.14□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COQ2Q96H96 371 aa13.14□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CITED1Q99966 193 aa13.14□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDCA4Q9BXL8 241 aa13.14□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IL36GQ9NZH8 169 aa13.14□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIF25Q9UIL4 384 aa13.14□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FOXJ3Q9UPW0 622 aa13.14□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TCF19Q9Y242 345 aa13.14□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TPRKBQ9Y3C4 175 aa13.14□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM172BPA6NC97 362 aa13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MMP23AO75900 390 aa13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MAS1P04201 325 aa13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDK1P06493 297 aa13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NFYBP25208 207 aa13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BRS3P32247 399 aa13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RAB13P51153 203 aa13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRRX1P54821 245 aa13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PROK1P58294 105 aa13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BDH1Q02338 343 aa13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DOC2BQ14184 412 aa13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MPV17LQ2QL34 196 aa13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C6orf141Q5SZD1 244 aa13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATAD3CQ5T2N8 411 aa13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TREML4Q6UXN2 200 aa13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ASCL4Q6XD76 172 aa13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DPM3Q9P2X0 92 aa13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FBLN5Q9UBX5 448 aa13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa13.12□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRAV24A0A0B4J272 114 aa13.12□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa13.12□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LEUTXA8MZ59 168 aa13.12□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PEX14O75381 377 aa13.12□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GPX5O75715 221 aa13.12□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CD1AP06126 327 aa13.12□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIR2DS4P43632 304 aa13.12□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MED22Q15528 200 aa13.12□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NHLRC3Q5JS37 347 aa13.12□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AWAT2Q6E213 333 aa13.12□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 Q6ZTK2 550 aa13.12□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DYNAPQ8N1N2 210 aa13.12□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NKAIN3Q8N8D7 197 aa13.12□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 Q8NFD4 153 aa13.12□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MUL1Q969V5 352 aa13.12□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DERL3Q96Q80 235 aa13.12□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FKBP14Q9NWM8 211 aa13.12□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CALYQ9NYX4 217 aa13.12□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DSCAML1Q8TD84 2053 aa13.12□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa13.11□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DYNLT3P51808 116 aa13.11□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPHARQ15513 63 aa13.11□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa13.11□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM219Q86XT9 240 aa13.11□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDH26Q8IXH8 852 aa13.11□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MS4A15Q8N5U1 240 aa13.11□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SUMF2Q8NBJ7 301 aa13.11□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR4P4Q8NGL7 312 aa13.11□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MRGPRDQ8TDS7 321 aa13.11□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa13.11□□□□□ -0.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPACA1Q9HBV2 294 aa13.11□□□□□ -0.31
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