RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL7P13232 177 aa14.1□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERP29P30040 261 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 BAK1Q16611 211 aa14.1□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.1□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC10Q5BKY1 277 aa14.1□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 LYPD2Q6UXB3 125 aa14.1□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.1□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa14.1□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.1□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 LURAP1Q96LR2 239 aa14.1□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa14.1□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 PALMDQ9NP74 551 aa14.1□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFT46Q9NQC8 304 aa14.1□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAS2R8Q9NYW2 309 aa14.1□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLK11Q9UBX7 282 aa14.1□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa14.1□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPR37O15354 613 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ORC5O43913 435 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 UPK1BO75841 260 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 FCGR3AP08637 254 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 GSTT2BP0CG30 244 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPS2P15880 293 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 RCVRNP35243 200 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRBOX4Q5JUW0 171 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 GDPD3Q7L5L3 318 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 DYRK2Q92630 601 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM63Q969Q1 353 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYYR1Q96J86 154 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANAPC10Q9UM13 185 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 MGAT4AQ9UM21 535 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCDHB10Q9UN67 800 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 PKDREJQ9NTG1 2253 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ICE1Q9Y2F5 2266 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1B0GW55 424 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ECDO95905 644 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 MT-ND4P03905 459 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 DUX4L2P0CJ85 424 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 DUX4L3P0CJ86 424 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 DUX4L4P0CJ87 422 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 DUX4L5P0CJ88 424 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 DUX4L6P0CJ89 424 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 DUX4L7P0CJ90 424 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 SELLP14151 372 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 GDNFP39905 211 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 INPP1P49441 399 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 P2RX3P56373 397 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 AP3S2P59780 193 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 AESQ08117 197 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 C16orf87Q6PH81 154 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 MOB1BQ7L9L4 216 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 HOGA1Q86XE5 327 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 COQ2Q96H96 371 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR8B2Q96RD0 313 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 BPESC1Q9GZL8 116 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCB10Q9NRK6 738 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTSZQ9UBR2 303 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 DUX4Q9UBX2 424 aa14.09□□□□□ -0.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 MEIS3P1A6NDR6 274 aa14.08□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 DVL1O14640 695 aa14.08□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 LANCL1O43813 399 aa14.08□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 WNT2P09544 360 aa14.08□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSF1P09603 554 aa14.08□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAT1P18440 290 aa14.08□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPY4RP50391 375 aa14.08□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 EDDM3AQ14507 147 aa14.08□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6ZS49 121 aa14.08□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 TOMM5Q8N4H5 51 aa14.08□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 DEDD2Q8WXF8 326 aa14.08□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa14.08□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF25Q9UIL4 384 aa14.08□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.08□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 MEIKINA0A087WXM9 373 aa14.07□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.07□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 VWC2LB2RUY7 222 aa14.07□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 F5H0A9 414 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 NDUFB7P17568 137 aa14.07□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 GLIPR1P48060 266 aa14.07□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 EDDM3BP56851 147 aa14.07□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.07□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 C11orf91Q3C1V1 193 aa14.07□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.07□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF841Q6ZN19 808 aa14.07□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 GVQW1Q8N7I0 195 aa14.07□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF286AQ9HBT8 521 aa14.07□□□□□ -0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q9N2K0 584 aa14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 156.4 ms