RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418527.1

NPHP1-205, Transcript of nephrocystin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP1, Length 742 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1-205ENST00000418527 TMEM106BQ9NUM4 274 aa8.97□□□□□ -0.97
NPHP1-205ENST00000418527 COPZ2Q9P299 210 aa8.97□□□□□ -0.97
NPHP1-205ENST00000418527 PPIAL4AQ9Y536 164 aa8.97□□□□□ -0.97
NPHP1-205ENST00000418527 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
NPHP1-205ENST00000418527 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 FUOMA2VDF0 154 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 TMEM178BH3BS89 294 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 HPXP02790 462 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 CD3DP04234 171 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 SOD3P08294 240 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 FCGR3AP08637 254 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 DANCRP0C864 163 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 PSG2P11465 335 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 TSPAN5P62079 268 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 OXA1LQ15070 435 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 SHEQ5VZ18 495 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 C11orf71Q6IPW1 123 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 PLET1Q6UQ28 207 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 GDPD3Q7L5L3 318 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 NRARPQ7Z6K4 114 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 RTN4RL2Q86UN3 420 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 TMEM17Q86X19 198 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 OR4C16Q8NGL9 310 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 DYRK2Q92630 601 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 TIMD4Q96H15 378 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 SNX22Q96L94 193 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 PPA2Q9H2U2 334 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 ZNF665Q9H7R5 613 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 ING3Q9NXR8 418 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 MGAT4AQ9UM21 535 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 RELNP78509 3460 aa8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 FAM221AA4D161 298 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 M0QYG6 137 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 CD8AP01732 235 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 PMP2P02689 132 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 AMY2AP04746 511 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 CSN2P05814 226 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 NAT1P18440 290 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 LMO1P25800 156 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 GIFP27352 417 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 KIR2DS4P43632 304 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 KIR2DS1Q14954 304 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 GRK1Q15835 563 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 TEX36Q5VZQ5 186 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 OR52W1Q6IF63 320 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 MOB1BQ7L9L4 216 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 ZNF561Q8N587 486 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 OR4S1Q8NGB4 309 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 OR5D13Q8NGL4 314 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 MED30Q96HR3 178 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 PRRT1Q99946 306 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 TMEM165Q9HC07 324 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 ANAPC10Q9UM13 185 aa8.95□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 DSCAMO60469 2012 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 MGST3O14880 152 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 NDUFA2O43678 99 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 ZNF205O95201 554 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 CLDN1O95832 211 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 GYPAP02724 150 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 CD74P04233 296 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 DAOP14920 347 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 HRH1P35367 487 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 GLP1RP43220 463 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 CDK10Q15131 360 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 ZMYND11Q15326 602 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 KRBOX4Q5JUW0 171 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 FAM201AQ5SY85 155 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 CD177Q8N6Q3 437 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 OR5AP2Q8NGF4 316 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 ANGPTL6Q8NI99 470 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 MAFIPQ8WZ33 124 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 RAB1CQ92928 201 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 DNTTIP1Q9H147 329 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 NECAP2Q9NVZ3 263 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 EHFQ9NZC4 300 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa8.94□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
NPHP1-205ENST00000418527 CHD6Q8TD26 2715 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms