RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411249.1

RNU6-1199P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1199, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1199P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SCD5Q86SK9 330 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MARCH3Q86UD3 253 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TBC1D21Q8IYX1 336 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 OR5T3Q8NGG3 340 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NT5CQ8TCD5 201 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SPPL2BQ8TCT7 592 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MCUR1Q96AQ8 359 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TMIGD2Q96BF3 282 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RILPQ96NA2 401 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PLIN2Q99541 437 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CHP1Q99653 195 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DEFB129Q9H1M3 183 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 VPS37BQ9H9H4 285 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TMCC3Q9ULS5 477 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FLVCR2Q9UPI3 526 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 C22orf24Q9Y442 160 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 LAMB4A4D0S4 1761 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SPOPO43791 374 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SOD1P00441 154 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ATF1P18846 271 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CD200P41217 278 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CLDN6P56747 220 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ATP6V0D1P61421 351 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RAD51Q06609 339 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 OR8G1Q15617 311 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MAJINQ3KP22 176 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SDIM1Q6ZPB5 146 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CYP4Z1Q86W10 505 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 APRG1Q8IVJ8 170 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 OR52K1Q8NGK4 314 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TCP10LQ8TDR4 215 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 LINC01587Q99440 93 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ANP32EQ9BTT0 268 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PECRQ9BY49 303 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NT5C3AQ9H0P0 336 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CLSTN2Q9H4D0 955 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 VCX3AQ9NNX9 186 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CFL2Q9Y281 166 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 KLF12Q9Y4X4 402 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 WDR19Q8NEZ3 1342 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SSPOA2VEC9 5147 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DHRS12A0PJE2 317 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 H7C2Y5 167 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TACSTD2P09758 323 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RPL14P50914 215 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RELAQ04206 551 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SLC38A11Q08AI6 406 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 C2orf80Q0P641 193 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NNATQ16517 81 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ACTBL2Q562R1 376 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TPRG1LQ5T0D9 272 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FAM27D1Q5T7N8 215 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TMEM53Q6P2H8 277 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 EPGNQ6UW88 154 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 Q6ZTI0 123 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SLC35F6Q8N357 371 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TRAM1L1Q8N609 369 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ZNF283Q8N7M2 679 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 OR8B12Q8NGG6 310 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 LHFPL5Q8TAF8 219 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CD200R1Q8TD46 325 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SPACA4Q8TDM5 124 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 C16orf78Q8WTQ4 265 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 KCTD4Q8WVF5 259 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ISOC2Q96AB3 205 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 REEP6Q96HR9 211 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 OPALINQ96PE5 141 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 COA1Q9GZY4 146 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SLC38A1Q9H2H9 487 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ARMC7Q9H6L4 198 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 C12orf4Q9NQ89 552 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TFR2Q9UP52 801 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 STK38LQ9Y2H1 464 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MAST4O15021 2626 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 M0QXV9 152 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ALOX12BO75342 701 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 OR5AL1P0C617 328 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PRKACAP17612 351 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GABRA3P34903 492 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 HCCSP53701 268 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 HOXC5Q00444 222 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MMDQ15546 238 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PSG3Q16557 428 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 Q499Y3 187 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SPANXN2Q5MJ10 180 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GLYATQ6IB77 296 aa0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms