RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM104Q8NE00 496 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNFRSF14Q92956 283 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A28Q96A46 364 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q96M66 194 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 JMJD8Q96S16 334 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GFI1Q99684 422 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SELENOIQ9C0D9 397 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAS2R3Q9NYW6 316 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBLN5Q9UBX5 448 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ODAMA1E959 279 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM14DPA8MWL7 114 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CA11O75493 328 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBE2E1P51965 193 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DLX6P56179 175 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C11orf42Q8N5U0 333 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SUMF2Q8NBJ7 301 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LHX4Q969G2 390 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COQ2Q96H96 371 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCTD7Q96MP8 289 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM59Q9BXS4 323 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BANF2Q9H503 90 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SIRT7Q9NRC8 400 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF69Q9UC07 566 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STEAP1Q9UHE8 339 aa12.54□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SVEP1Q4LDE5 3571 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFITM5A6NNB3 132 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AIPO00170 330 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MPIG6BO95866 241 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCL3L1P16619 93 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FUT3P21217 361 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GLIPR1P48060 266 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 QRFPP83859 136 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AESQ08117 197 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM189A2Q15884 450 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATAD3CQ5T2N8 411 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC35E4Q6ICL7 350 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LIAT1Q6ZQX7 453 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TCF23Q7RTU1 214 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TPRX1Q8N7U7 411 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF565Q8N9K5 539 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TM2D1Q9BX74 207 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR51E2Q9H255 320 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa12.52□□□□□ -0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SHISA3A0PJX4 238 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NOTOA8MTQ0 251 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MCRIP1C9JLW8 97 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSPB6O14558 160 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM127O75204 238 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDCD6O75340 191 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GADD45AP24522 165 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HILS1P60008 231 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM46BQ96A09 425 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM3DQ96BQ1 224 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC6A7Q99884 636 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRDM13Q9H4Q3 707 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NF1P21359 2839 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZFHX3Q15911 3703 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MEIKINA0A087WXM9 373 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLPXO76031 633 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMIM18P0DKX4 95 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV1-8P0DP01 117 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UNC119Q13432 240 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 P2RY14Q15391 338 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MIDNQ504T8 468 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR52W1Q6IF63 320 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB12Q6IQ22 244 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HEPN1Q6WQI6 88 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR13D1Q8NGV5 346 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEK7Q8TDX7 302 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZFAND2BQ8WV99 257 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 YIPF6Q96EC8 236 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEDD4LQ96PU5 975 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PEX16Q9Y5Y5 336 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SESN1Q9Y6P5 492 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCA2Q9BZC7 2435 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPFFO15130 113 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LDLRAD4O15165 306 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AIREO43918 545 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GZMHP20718 246 aa12.5□□□□□ -0.41
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