RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384545.1

RNU6-441P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 441, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-441P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZNF678Q5SXM1 525 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 PRSS54Q6PEW0 395 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 SLC35G3Q8N808 338 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZNF565Q8N9K5 539 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZIC4Q8N9L1 334 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 OR8A1Q8NGG7 326 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 ESR2Q92731 530 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 DHRS9Q9BPW9 319 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 TMEM208Q9BTX3 173 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 ARL6Q9H0F7 186 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 MTCH2Q9Y6C9 303 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 A0A1B0GVY2 172 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 GMNCA6NCL1 334 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 M0QZ92 97 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 TCF21O43680 179 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 STX10O60499 249 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 ASS1P00966 412 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 SLC6A1P30531 599 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 HSPA13P48723 471 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZNF83P51522 516 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 PFN3P60673 137 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 SKP2Q13309 424 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 C4orf26Q17RF5 130 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 TMEM241Q24JQ0 296 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 XKRXQ6PP77 449 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 SPNS3Q6ZMD2 512 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 DCXRQ7Z4W1 244 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 NT5DC3Q86UY8 548 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 TMEM105Q8N8V8 129 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 CLDN23Q96B33 292 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 PPP1R36Q96LQ0 422 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 KCTD7Q96MP8 289 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 CHST5Q9GZS9 411 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 UCK1Q9HA47 277 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 TMEM38BQ9NVV0 291 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 FAM206AQ9NX38 181 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 IL37Q9NZH6 218 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 RIMS2Q9UQ26 1411 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 BTRCQ9Y297 605 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 SNX10Q9Y5X0 201 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 LRP4O75096 1905 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 C7orf66A4D0T2 115 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 METTL15A6NJ78 407 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 SMIM23A6NLE4 172 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 K7EPK0 472 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 SSNA1O43805 119 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 GTF2F2P13984 249 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 CD99P14209 185 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 ADORA1P30542 326 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 GTF2BQ00403 316 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 MGAT3Q09327 533 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 SMAGPQ0VAQ4 97 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 FAM53BQ14153 422 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 COX19Q49B96 90 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 ABCA11PQ4W5N1 156 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 FAM104BQ5XKR9 115 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 TMEM215Q68D42 235 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 CASP12Q6UXS9 341 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 OR2M3Q8NG83 312 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 OR8J2Q8NGG1 315 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 OR2K2Q8NGT1 345 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 ERMNQ8TAM6 284 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 RNF133Q8WVZ7 376 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 IP6K3Q96PC2 410 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 PRSS27Q9BQR3 290 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 ATRNO75882 1429 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 PTPRKQ15262 1439 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 LRRN3E7EW58 273 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 H0Y980 276 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 AZIN1O14977 448 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 PFDN6O15212 129 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 NRASP01111 189 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 HRASP01112 189 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 KRASP01116 189 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 LHBP01229 141 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 OR5AC1P0C628 307 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-441P-201ENST00000384545 CFL1P23528 166 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms