RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF565Q8N9K5 539 aa12.62□□□□□ -0.39
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PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM158Q8WZ71 300 aa12.6□□□□□ -0.39
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PGGT1B-202ENST00000379615 PEX16Q9Y5Y5 336 aa12.59□□□□□ -0.39
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PGGT1B-202ENST00000379615 PAHP00439 452 aa12.58□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 GZMHP20718 246 aa12.58□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 LGALS4P56470 323 aa12.58□□□□□ -0.4
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PGGT1B-202ENST00000379615 HEPN1Q6WQI6 88 aa12.58□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A28Q96A46 364 aa12.58□□□□□ -0.4
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PGGT1B-202ENST00000379615 GFI1Q99684 422 aa12.58□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa12.58□□□□□ -0.4
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PGGT1B-202ENST00000379615 FBLN5Q9UBX5 448 aa12.58□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 KIF25Q9UIL4 384 aa12.58□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 SESN1Q9Y6P5 492 aa12.58□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 IFITM5A6NNB3 132 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM14DPA8MWL7 114 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 PDCD6O75340 191 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 VENTXO95231 258 aa12.57□□□□□ -0.4
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