RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 CSNK1A1LQ8N752 337 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 GVQW1Q8N7I0 195 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 GATSQ8NAP1 163 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 OR1M1Q8NGA1 313 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 OR4S1Q8NGB4 309 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 OR51A2Q8NGJ7 313 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 OR10G6Q8NH81 332 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 STOML3Q8TAV4 291 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 RXFP4Q8TDU9 374 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 PAQR8Q8TEZ7 354 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 GLYATL2Q8WU03 294 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 PATE1Q8WXA2 126 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 ASB17Q8WXJ9 295 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 ARL11Q969Q4 196 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 CMBLQ96DG6 245 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 FAHD2AQ96GK7 314 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 CAPNS2Q96L46 248 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 PRRT1Q99946 306 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 NUDT9Q9BW91 350 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 SEC11CQ9BY50 192 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 SELENOIQ9C0D9 397 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 SYT4Q9H2B2 425 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 HRH4Q9H3N8 390 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 FN3KRPQ9HA64 309 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 UBQLN4Q9NRR5 601 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 ASF1BQ9NVP2 202 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 HRASLS2Q9NWW9 162 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 SLC39A1Q9NY26 324 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 SLC2A8Q9NY64 477 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 TAS2R4Q9NYW5 299 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 MBD2Q9UBB5 411 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 MLXQ9UH92 298 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 SHPKQ9UHJ6 478 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 ATPIF1Q9UII2 106 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 RAB22AQ9UL26 194 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 ANAPC10Q9UM13 185 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 GPR132Q9UNW8 380 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 OR10H1Q9Y4A9 318 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 MYO7AQ13402 2215 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 A0A0A6YYD4 124 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM235A6NFC5 223 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 CEACAM18A8MTB9 384 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 FAM25EA8MYX2 175 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 C11orf98E9PRG8 122 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 I3L1I5 382 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 PLPP3O14495 311 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF264O43296 627 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 OR2T1O43869 369 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 FADS1O60427 444 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 NPIPB7O75200 414 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 STK17BO94768 372 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 SNAPINO95295 136 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 MPZL1O95297 269 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 CYB5AP00167 134 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 IGHMP01871 453 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 APOC1P02654 83 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 ISG15P05161 165 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 CSN2P05814 226 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 CD5P06127 495 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 DCNP07585 359 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 SPP1P10451 314 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 GP1BBP13224 206 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 TPT1P13693 172 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 PGAM2P15259 253 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 CTLA4P16410 223 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 CXCR1P25024 350 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 NFYBP25208 207 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 HSD11B1P28845 292 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 RABIFP47224 123 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 GABRA4P48169 554 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 KCNJ3P48549 501 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 DNASE1L1P49184 302 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 CX3CR1P49238 355 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 CAV2P51636 162 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 PRKXP51817 358 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 AKR1D1P51857 326 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 RIDAP52758 137 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 RPL27P61353 136 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF117Q03924 483 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 ECH1Q13011 328 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 PDZK1IP1Q13113 114 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 UNC119Q13432 240 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 OR7A5Q15622 319 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRK-202ENST00000368205 NNATQ16517 81 aa2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms