RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 TK1P04183 234 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 IFNA6P05013 189 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 CSN2P05814 226 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 FCGR3AP08637 254 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 AKAIN1P0CW23 69 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 NDUFB7P17568 137 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 DNASE1P24855 282 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 OR3A1P47881 315 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 EDDM3BP56851 147 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TAS2R46P59540 309 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ZMYND11Q15326 602 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 RGS21Q2M5E4 152 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 CHRFAM7AQ494W8 412 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 SLC35E4Q6ICL7 350 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF788Q6ZQV5 615 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 MOB1BQ7L9L4 216 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 NLRC3Q7RTR2 1065 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 HOGA1Q86XE5 327 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 SPICQ8N5J4 248 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 GVQW1Q8N7I0 195 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ZNRF1Q8ND25 227 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 BEST4Q8NFU0 473 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 OR4S1Q8NGB4 309 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 OR4K15Q8NH41 348 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 DEDD2Q8WXF8 326 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 GAFA1Q96PS6 74 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 KCNIP1Q9NZI2 227 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 MIOXQ9UGB7 285 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 METRNQ9UJH8 293 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF222Q9UK12 451 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 LRRK2Q5S007 2527 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 MEIKINA0A087WXM9 373 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM82A0PJX8 343 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 NAP1L6A6NFF2 107 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 POM121CA8CG34 1229 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 K7N7A8 449 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 LYRM1O43325 122 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 LANCL1O43813 399 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 RAB3DO95716 219 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV4-39P01824 125 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 RPS2P15880 293 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 HLA-DMAP28067 261 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 KIR2DS4P43632 304 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 DYRK1AQ13627 763 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 KIR2DS1Q14954 304 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM155Q4W5P6 130 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 STEAP1BQ6NZ63 245 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 CLEC2AQ6UVW9 174 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF497Q6ZNH5 498 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 C17orf107Q6ZR85 190 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 DNM1P46Q6ZS02 220 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 FAM216BQ8N7L0 139 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 OR8B3Q8NGG8 313 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 OR5H2Q8NGV7 314 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC107Q8WV48 283 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 MAFIPQ8WZ33 124 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 PERPQ96FX8 193 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 OR8B2Q96RD0 313 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 LIME1Q9H400 295 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 RAB9BQ9NP90 201 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 MCUBQ9NWR8 336 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 MAB21L2Q9Y586 359 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 DISC1C4P0D8 188 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF737O75373 536 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TBPP20226 339 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 IFITM3Q01628 133 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 AESQ08117 197 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ASAH1Q13510 395 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 MEF2DQ14814 521 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 C6orf183Q5T699 404 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 OR52W1Q6IF63 320 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TRAT1Q6PIZ9 186 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM17Q86X19 198 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF525Q8N782 197 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 OR5AP2Q8NGF4 316 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ENKURQ8TC29 256 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 IGFBPL1Q8WX77 278 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 FAM168AQ92567 244 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 NRGNQ92686 78 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 PIMREGQ9BSJ6 248 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 Q9N2K0 584 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 NECAP2Q9NVZ3 263 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 KAAG1Q9UBP8 84 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 KIF25Q9UIL4 384 aa10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms