RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 PAX6P26367 422 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF611Q8N823 705 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 Q8NFD4 153 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FDCSPQ8NFU4 85 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 OR11L1Q8NGX0 322 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF122Q9H9V4 155 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 ABI3Q9P2A4 366 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FOLR2P14207 255 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 NPBWR2P48146 333 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 LGI3Q8N145 548 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 EGLN1Q9GZT9 426 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 DIRAS3O95661 229 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 GLI4P10075 376 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 AADACP22760 399 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 UCP2P55851 309 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 CLEC9AQ6UXN8 241 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC25A26Q70HW3 274 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 SMCO4Q9NRQ5 59 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 PARPBPQ9NWS1 579 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 IGF2RP11717 2491 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 DUSP1P28562 367 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 CTAG1AP78358 180 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 SWI5Q1ZZU3 235 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR157Q5UAW9 335 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 OR52M1Q8NGK5 317 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 OR51B6Q9H340 312 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF442Q9H7R0 627 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 PLSCR2Q9NRY7 297 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 ATPIF1Q9UII2 106 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 HLA-HP01893 362 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 SEC11BP0C7V7 166 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 GLP1RP43220 463 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNJ3P48549 501 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 AKR1E2Q96JD6 320 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 C12orf57Q99622 126 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 SCRT1Q9BWW7 348 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 WFDC1Q9HC57 220 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR137BO60478 399 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 DANCRP0C864 163 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 HMGN3Q15651 99 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 COMMD1Q8N668 190 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 ASCL3Q9NQ33 180 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 B4GALT7Q9UBV7 327 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 KPTNQ9Y664 436 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 SNCAP37840 140 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 HERV-K104P61576 105 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 SECTM1Q8WVN6 248 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC00470Q9BZP3 86 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC01387J3KSC0 135 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 PPYP01298 95 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 P2RY1P47900 373 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 ARF1P84077 181 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 IL13RA2Q14627 380 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 C15orf54Q8N8G6 183 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 TP53RKQ96S44 253 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 GINS3Q9BRX5 216 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM90A10PA6NDY2 464 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM90A18PA6NE21 464 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM90A16PA6NEW6 464 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM90A7PA6NKC0 464 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM90A22PA8MWA6 464 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM90A12PA8MX19 464 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM90A15PP0C7V4 464 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM90A13PP0C7W8 464 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM90A14PP0C7W9 464 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM90A24PP0C7X0 464 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 IGSF11Q5DX21 431 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXW12Q6X9E4 464 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 GCNT2Q8N0V5 402 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 C2CD4CQ8TF44 421 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 TMED3Q9Y3Q3 217 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PR80 420 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 ST8SIA3O43173 380 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 IFNA4P05014 189 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF766Q5HY98 468 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 Q6ZS49 121 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 MDS2Q8NDY4 140 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 LUZP4Q9P127 313 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-201ENST00000357436 C3orf80F5H4A9 247 aa16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms