RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 MPV17LQ2QL34 196 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 RAB12Q6IQ22 244 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 CHST4Q8NCG5 386 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 NDNFQ8TB73 568 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 C22orf15Q8WYQ4 148 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 BEX2Q9BXY8 128 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 BARHL1Q9BZE3 327 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 IFT22Q9H7X7 185 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 KIF25Q9UIL4 384 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-201ENST00000309641 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 J3QLI3 93 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 MMP23AO75900 390 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 TOX4O94842 621 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 FSHBP01225 129 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 CSN2P05814 226 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 CHATP28329 748 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 SERPINB10P48595 397 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM50BP56557 158 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 KLRD1Q13241 179 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 MOGAT2Q3SYC2 334 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 KRBOX4Q5JUW0 171 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 IDNKQ5T6J7 187 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 OR5H6Q8NGV6 325 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 UPRTQ96BW1 309 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 MRI1Q9BV20 369 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 TM2D1Q9BX74 207 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM160Q9NX00 188 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 SCOCQ9UIL1 159 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 ODAMA1E959 279 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 UBE2QL1A1L167 161 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 FUT3P21217 361 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 OMGP23515 440 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 VEGFCP49767 419 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 UTF1Q5T230 341 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 OLFML2AQ68BL7 652 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 Q6ZPA2 131 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 OR2W3Q7Z3T1 314 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 PNKDQ8N490 385 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 LGALS14Q8TCE9 139 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 NEK7Q8TDX7 302 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 TNFRSF14Q92956 283 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 MEIKINA0A087WXM9 373 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 A0A1W2PRD5 423 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 A0A1W2PRF3 423 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 A0A1W2PRM7 423 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 PDCD6O75340 191 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 ERP29P30040 261 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 GDNFP39905 211 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 SPCS2Q15005 226 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 CHRFAM7AQ494W8 412 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 LINC00596Q86U02 117 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 UBALD1Q8TB05 177 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC107Q8WV48 283 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 LHX4Q969G2 390 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 KPTNQ9Y664 436 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 FAM90A10PA6NDY2 464 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 FAM90A18PA6NE21 464 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 FAM90A16PA6NEW6 464 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 FAM90A7PA6NKC0 464 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 FAM90A22PA8MWA6 464 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 FAM90A12PA8MX19 464 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-201ENST00000309641 RAB27BO00194 218 aa7.44□□□□□ -1.22
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