RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 SMIM4Q8WVI0 70 aa10□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 MAP1LC3AQ9H492 121 aa10□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 MPDU1O75352 247 aa10□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM65Q6PI78 240 aa10□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa10□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 R4GMQ9 66 aa10□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 CD3DP04234 171 aa10□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 FCARP24071 287 aa10□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 FPR2P25090 351 aa10□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa10□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ST3GAL2Q16842 350 aa10□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa10□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 HEPACAM2A8MVW5 462 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 SYPL1Q16563 259 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 VWA2Q5GFL6 755 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF441Q8N8Z8 693 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 OR2Z1Q8NG97 314 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 GGACTQ9BVM4 153 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 SFXN1Q9H9B4 322 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 PSMB5P28074 263 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 C1orf61Q13536 156 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC00303Q3SY05 128 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 OR52E1Q8NGJ3 308 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 FBXL17Q9UF56 701 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 MRGPRDQ8TDS7 321 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 MEGF9Q9H1U4 602 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 CD14P08571 375 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 IL13RA2Q14627 380 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 SGMS2Q8NHU3 365 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 OR8B2Q96RD0 313 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM219BQ5XKK7 198 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 PRNTQ86SH4 94 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 LRRC75AQ8NAA5 344 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 PBOV1Q9GZY1 135 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 WDR13Q9H1Z4 485 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 K7ESF4 209 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 M0QZQ0 153 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 CTNSO60931 367 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ADAP1O75689 374 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 VMA21Q3ZAQ7 101 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ONECUT1Q9UBC0 465 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 C7orf71A4D174 169 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 MMP9P14780 707 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ACVR1Q04771 509 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 PLA1AQ53H76 456 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 RDH5Q92781 318 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 EGLN2Q96KS0 407 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ORM2P19652 201 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 SCD5Q86SK9 330 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC5A6Q9Y289 635 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 STARD10Q9Y365 291 aa9.99□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 SIGLEC14Q08ET2 396 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ANKRD37Q7Z713 158 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 FBXL6Q8N531 539 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ST6GAL2Q96JF0 529 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ABCA3Q99758 1704 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 TAPBPO15533 448 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 CRYAAP02489 173 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ADRA2AP08913 450 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF511Q8NB15 262 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 CDCA4Q9BXL8 241 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 VN1R1Q9GZP7 353 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 CYSLTR1Q9Y271 337 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 C9orf170A2RU37 121 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 CSNK1DP48730 415 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 KLK11Q9UBX7 282 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 J3KRW8 73 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 PLAUP00749 431 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 PPP1R1AQ13522 171 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 TREM2Q9NZC2 230 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 DHRS2Q13268 280 aa9.98□□□□□ -0.81
HDGFL3-201ENST00000299633 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms