RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295767.9

CHCHD4-201, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4, humanhuman

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Gene CHCHD4, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4-201ENST00000295767 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CHCHD4-201ENST00000295767 TMEM249Q2WGJ8 235 aa22.97■■□□□ 1.27
CHCHD4-201ENST00000295767 TPRX1Q8N7U7 411 aa22.97■■□□□ 1.27
CHCHD4-201ENST00000295767 DTX3Q8N9I9 347 aa22.97■■□□□ 1.27
CHCHD4-201ENST00000295767 DYRK2Q92630 601 aa22.97■■□□□ 1.27
CHCHD4-201ENST00000295767 C1orf159Q96HA4 380 aa22.97■■□□□ 1.27
CHCHD4-201ENST00000295767 LPAR2Q9HBW0 351 aa22.97■■□□□ 1.27
CHCHD4-201ENST00000295767 KCNK7Q9Y2U2 307 aa22.97■■□□□ 1.27
CHCHD4-201ENST00000295767 FAM25AB3EWG3 89 aa22.96■■□□□ 1.27
CHCHD4-201ENST00000295767 FAM25CB3EWG5 89 aa22.96■■□□□ 1.27
CHCHD4-201ENST00000295767 FAM25GB3EWG6 89 aa22.96■■□□□ 1.27
CHCHD4-201ENST00000295767 GPR37O15354 613 aa22.96■■□□□ 1.27
CHCHD4-201ENST00000295767 EDDM3BP56851 147 aa22.96■■□□□ 1.27
CHCHD4-201ENST00000295767 SPNS3Q6ZMD2 512 aa22.96■■□□□ 1.27
CHCHD4-201ENST00000295767 BTN2A1Q7KYR7 527 aa22.96■■□□□ 1.27
CHCHD4-201ENST00000295767 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CHCHD4-201ENST00000295767 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CHCHD4-201ENST00000295767 DIABLOQ9NR28 239 aa22.96■■□□□ 1.27
CHCHD4-201ENST00000295767 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa22.95■■□□□ 1.27
CHCHD4-201ENST00000295767 A0A0A6YYH2 397 aa22.95■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 A6NJ64 397 aa22.95■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 FOXH1O75593 365 aa22.95■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 GNB3P16520 340 aa22.95■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 KCNJ3P48549 501 aa22.95■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 OLFML2AQ68BL7 652 aa22.95■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 IZUMO1Q8IYV9 350 aa22.95■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 OR4M1Q8NGD0 313 aa22.95■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 C22orf46C9J442 243 aa22.94■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 MFNGO00587 321 aa22.94■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 KRBOX4Q5JUW0 171 aa22.94■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 COX4I2Q96KJ9 171 aa22.94■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 DCTN5Q9BTE1 182 aa22.94■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 ETAA1Q9NY74 926 aa22.94■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 IGHV4-31P0DP07 118 aa22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 GLIPR1P48060 266 aa22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 P2RX3P56373 397 aa22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 C19orf12Q9NSK7 152 aa22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 ADAM30Q9UKF2 790 aa22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 TRAV18A0A075B6X5 111 aa22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 LOC105371242A0A075B767 164 aa22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 XRCC3O43542 346 aa22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 ERP29P30040 261 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 PAX5Q02548 391 aa22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 CDNFQ49AH0 187 aa22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 AK3Q9UIJ7 227 aa22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 KIF25Q9UIL4 384 aa22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 B4DSR2 109 aa22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 ECDO95905 644 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 RPL31P62899 125 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 ZNF260Q3ZCT1 412 aa22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 TMEM69Q5SWH9 247 aa22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 CD276Q5ZPR3 534 aa22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 ZNF497Q6ZNH5 498 aa22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 EXTL2Q9UBQ6 330 aa22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 MSMBP08118 114 aa22.91■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 PAX2Q02962 417 aa22.91■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 MADCAM1Q13477 382 aa22.91■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 C11orf91Q3C1V1 193 aa22.91■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 SLC35E4Q6ICL7 350 aa22.91■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 CNIH2Q6PI25 160 aa22.91■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 LINC01356Q8N9X3 169 aa22.91■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa22.91■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 WNK2Q9Y3S1 2297 aa22.91■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 TMEM235A6NFC5 223 aa22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 CLPXO76031 633 aa22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 TAS2R20P59543 309 aa22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 ARL6IP1Q15041 203 aa22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 C8orf46Q8TAG6 207 aa22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 WDFY2Q96P53 400 aa22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 MMP26Q9NRE1 261 aa22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 PTTG2Q9NZH5 202 aa22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 ODAMA1E959 279 aa22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 FUOMA2VDF0 154 aa22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 SERPINE3A8MV23 424 aa22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 CA11O75493 328 aa22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 TNFSF8P32971 234 aa22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 GZMKP49863 264 aa22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 TCF23Q7RTU1 214 aa22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 FAM185AQ8N0U4 392 aa22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 GAPTQ8N292 157 aa22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CHCHD4-201ENST00000295767 ZANQ9Y493 2812 aa22.89■■□□□ 1.25
CHCHD4-201ENST00000295767 MEIKINA0A087WXM9 373 aa22.89■■□□□ 1.25
CHCHD4-201ENST00000295767 MT-ND4P03905 459 aa22.89■■□□□ 1.25
CHCHD4-201ENST00000295767 LY6G5BQ8NDX9 201 aa22.89■■□□□ 1.25
CHCHD4-201ENST00000295767 DIRAS2Q96HU8 199 aa22.89■■□□□ 1.25
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