RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 MMP16P51512 607 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 CLRN1P58418 232 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 RAB4BP61018 213 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 FOXK1P85037 733 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 TNFRSF9Q07011 255 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 CST9LP1Q5W188 147 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 NCR3LG1Q68D85 454 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 ASCL5Q7RTU5 278 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 OR2C3Q8N628 320 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 MVB12AQ96EY5 273 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 FAAP24Q9BTP7 215 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 NDUFAF3Q9BU61 184 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 A6NNC1 897 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 RER1O15258 196 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 LYL1P12980 280 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 BTF3P20290 206 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 H3F3AP84243 136 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 HIKESHIQ53FT3 197 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 C9orf135Q5VTT2 229 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 PITPNC1Q9UKF7 332 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 SRPK3Q9UPE1 567 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 TMED3Q9Y3Q3 217 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.45□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 A0A1B0GX78 115 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 SLC6A8P48029 635 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 TESK1Q15569 626 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 KISS1Q15726 138 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 FAM189A2Q15884 450 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 PCK2Q16822 640 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 DEFB109BQ30KR1 87 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF695Q8IW36 515 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 OR5B12Q96R08 314 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 A0A1W2PR80 420 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 FOXS1O43638 330 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 FTH1P19P0C7X4 201 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 FAHP16930 419 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 MPZP25189 248 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 GLIPR1P48060 266 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 SYT3Q9BQG1 590 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 ZZEF1O43149 2961 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 A8MWP6 167 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 PPP5D1E7EU14 171 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 M0R143 59 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 PLPP3O14495 311 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 HSD17B6O14756 317 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 OR2J2O76002 312 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 EDN3P14138 238 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 RPS2P15880 293 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 FOLR3P41439 243 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 FASLGP48023 281 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 PLGLB1Q02325 96 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 GINS3Q9BRX5 216 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 PECRQ9BY49 303 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 GPR173Q9NS66 373 aa9.44□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 FAM166BA8MTA8 275 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 TGOLN2O43493 480 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 GZMBP10144 247 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 TLE4Q04727 773 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 CLN3Q13286 438 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 OR8B12Q8NGG6 310 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 TWSG1Q9GZX9 223 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 DKKL1Q9UK85 242 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 WNK2Q9Y3S1 2297 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 CSPG4Q6UVK1 2322 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 MSTNO14793 375 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 NKX2-8O15522 239 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 MT-ATP6P00846 226 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 AMBPP02760 352 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 ISG15P05161 165 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 DBHP09172 617 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 QRFPP83859 136 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 NEK7Q8TDX7 302 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF665Q9H7R5 613 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 KIAA1456Q9P272 454 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 K7N7A8 449 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 IGHV3-9P01782 118 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 HSF1Q00613 529 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 PAX5Q02548 391 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 IL15RAQ13261 267 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 OR10A7Q8NGE5 316 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF519Q8TB69 540 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 DTD1Q8TEA8 209 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 METTL9Q9H1A3 318 aa9.43□□□□□ -0.9
CNGA3-201ENST00000272602 NAA60Q9H7X0 242 aa9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms