RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 A0A1W2PR80 420 aa6.9□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 FITM1A5D6W6 292 aa6.9□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 OR5B21A6NL26 309 aa6.9□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 FABP5Q01469 135 aa6.9□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 DUSP5Q16690 384 aa6.9□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 PCSK4Q6UW60 755 aa6.9□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 DRAM2Q6UX65 266 aa6.9□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.9□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 GALMQ96C23 342 aa6.9□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 C4orf45Q96LM5 186 aa6.9□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 SOX7Q9BT81 388 aa6.9□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.9□□□□□ -1.31
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USP3-201ENST00000268049 A0A1W2PR48 441 aa6.9□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 A0A1W2PR77 199 aa6.9□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 TMEM210A6NLX4 147 aa6.9□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 TMPRSS2O15393 492 aa6.9□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 DCTDP32321 178 aa6.9□□□□□ -1.31
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USP3-201ENST00000268049 CHRNA7P36544 502 aa6.9□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 AMTP48728 403 aa6.9□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.9□□□□□ -1.31
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USP3-201ENST00000268049 MZB1Q8WU39 189 aa6.9□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.9□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.9□□□□□ -1.31
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USP3-201ENST00000268049 LOC105371242A0A075B767 164 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 IGLV3-19P01714 112 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 CD3DP04234 171 aa6.89□□□□□ -1.31
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USP3-201ENST00000268049 Q6ZSR9 355 aa6.89□□□□□ -1.31
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USP3-201ENST00000268049 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 ALOX5APP20292 161 aa6.89□□□□□ -1.31
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USP3-201ENST00000268049 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa6.89□□□□□ -1.31
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USP3-201ENST00000268049 C3AR1Q16581 482 aa6.89□□□□□ -1.31
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USP3-201ENST00000268049 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 SDF2Q99470 211 aa6.89□□□□□ -1.31
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USP3-201ENST00000268049 Q9N2K0 584 aa6.89□□□□□ -1.31
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USP3-201ENST00000268049 A0A1W2PQD3 144 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 K7ENP7 123 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
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USP3-201ENST00000268049 RNF224P0DH78 156 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 RPA2P15927 270 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 PDCD1Q15116 288 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-201ENST00000268049 UBE2V2Q15819 145 aa6.88□□□□□ -1.31
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