RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223423.8

PTGS1-201, Transcript of prostaglandin-endoperoxide synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGS1, Length 2,328 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1-201ENST00000223423 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 MED9Q9NWA0 146 aa10.64□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 SDHAF2Q9NX18 166 aa10.64□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 RASL12Q9NYN1 266 aa10.64□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa10.64□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 LRP5LA4QPB2 252 aa10.64□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 TRDCB7Z8K6 153 aa10.64□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 HOXC12P31275 282 aa10.64□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 ZNF154Q13106 437 aa10.64□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 Q6P435 159 aa10.64□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 Q6ZS92 163 aa10.64□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 PDZD9Q8IXQ8 264 aa10.64□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 ANGPTL6Q8NI99 470 aa10.64□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 GLYATL2Q8WU03 294 aa10.64□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 SPACA1Q9HBV2 294 aa10.64□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 CYTL1Q9NRR1 136 aa10.64□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 SELEP16581 610 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 GNRHRP30968 328 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 ERVK11-1P61568 191 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 LYZL2Q7Z4W2 148 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 FOXRED2Q8IWF2 684 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 SLC25A32Q9H2D1 315 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 LUZP4Q9P127 313 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 TUBD1Q9UJT1 453 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 MEMO1Q9Y316 297 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 ATP23Q9Y6H3 246 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 CDIPTO14735 213 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 CACNA1GO43497 2377 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 IFNA21P01568 189 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 TK1P04183 234 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 CECR9P0C854 216 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 KCNJ3P48549 501 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 LIAT1Q6ZQX7 453 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 LHFPL5Q8TAF8 219 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 C18orf12Q96KH6 178 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 AQP10Q96PS8 301 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 TP53RKQ96S44 253 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 SUCNR1Q9BXA5 334 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 IFT22Q9H7X7 185 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 PROCRQ9UNN8 238 aa10.63□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 DEGS1O15121 323 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 IGKV1-13P0DP09 117 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 ZNF44P15621 663 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 KIR2DS4P43632 304 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 KIR2DS1Q14954 304 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 RPRMLQ8N4K4 120 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 LRTM2Q8N967 370 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 PHYHIPLQ96FC7 376 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 SYT3Q9BQG1 590 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 TINAGQ9UJW2 476 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 ESPL1Q14674 2120 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 TPRP12270 2363 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 MPPED1O15442 326 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 MLNRO43193 412 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 TUSC2O75896 110 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 DIRAS3O95661 229 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 GRPP07492 148 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 PET100P0DJ07 73 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 PGA5P0DJD9 388 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 OR8G1Q15617 311 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 ZNF880Q6PDB4 577 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 PCSK4Q6UW60 755 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 CCDC28AQ8IWP9 274 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 STOML3Q8TAV4 291 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 SECTM1Q8WVN6 248 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 NRIP2Q9BQI9 281 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 RHOFQ9HBH0 211 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 PFDN2Q9UHV9 154 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 FZR1Q9UM11 496 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 MSRB2Q9Y3D2 182 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 ITPR1Q14643 2758 aa10.62□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 H7C1Q1 480 aa10.61□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 SHOXO15266 292 aa10.61□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 OR2H2O95918 312 aa10.61□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 IGLV1-44P01699 117 aa10.61□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 GLAP06280 429 aa10.61□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa10.61□□□□□ -0.71
PTGS1-201ENST00000223423 LDLRAD3Q86YD5 345 aa10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms