RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 RDH8Q9NYR8 311 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 RAXQ9Y2V3 346 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ATMQ13315 3056 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 OR2H2O95918 312 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 CFDP00746 253 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 PPYP01298 95 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 KIR2DS4P43632 304 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 HERV-K104P61576 105 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 KIR2DS1Q14954 304 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 HERPUD1Q15011 391 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF146Q15072 292 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF826PQ6ZT77 177 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF546Q86UE3 836 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 SPERTQ8NA61 448 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 MFFQ9GZY8 342 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 SIRPB1O00241 398 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 RBMXP38159 391 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC38A6Q8IZM9 456 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 RSRP1Q9BUV0 290 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ARL6Q9H0F7 186 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 MPTX1A8MV57 137 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 UCNP55089 124 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 CYCSP99999 105 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 SPIN3Q5JUX0 258 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 MRGPRGQ86SM5 289 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 LRP11Q86VZ4 500 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 OR5T2Q8NGG2 359 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 NAA60Q9H7X0 242 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 C1orf123Q9NWV4 160 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 TNFSF18Q9UNG2 199 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 CADP27708 2225 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 BET1O15155 118 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 IFNA7P01567 189 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 CRYAAP02489 173 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 TK1P04183 234 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF250P15622 560 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 PHLDA2Q53GA4 152 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 OR10C1Q96KK4 312 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM165Q9HC07 324 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC2A9Q9NRM0 540 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 RASL12Q9NYN1 266 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 TREM2Q9NZC2 230 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 SPEF1Q9Y4P9 236 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 ERVH48-1M5A8F1 160 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 SH2D1BO14796 132 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 WNT9BO14905 357 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 PSMB6P28072 239 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 CCKARP32238 428 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 GLRXP35754 106 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 SHEQ5VZ18 495 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 WDR82Q6UXN9 313 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 GALNT14Q96FL9 552 aa14.57□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 A6NLC8 198 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 TUSC2O75896 110 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 DIRAS3O95661 229 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 HOXB5P09067 269 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 CTXN2P0C2S0 81 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF497Q6ZNH5 498 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 OR11L1Q8NGX0 322 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 THAP6Q8TBB0 222 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 RP2O75695 350 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 HAND1O96004 215 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 IGHV3-13P01766 116 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 S100A1P23297 94 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 HLA-DRB3P79483 266 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM187Q14656 261 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 GAPTQ8N292 157 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 C2orf50Q96LR7 162 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 UFSP2Q9NUQ7 469 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 MBD2Q9UBB5 411 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 UBQLN2Q9UHD9 624 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 DUSP13Q9UII6 198 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 POM121CA8CG34 1229 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 OR5AC1P0C628 307 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.7 ms