RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636351.1

CLN3-247, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,292 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-247ENST00000636351 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.25■■□□□ 1.15
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CLN3-247ENST00000636351 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.25■■□□□ 1.15
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CLN3-247ENST00000636351 CSRNP1Q96S65 589 aa22.23■■□□□ 1.15
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CLN3-247ENST00000636351 DACT2Q5SW24 774 aa22.22■■□□□ 1.15
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CLN3-247ENST00000636351 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.19■■□□□ 1.14
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CLN3-247ENST00000636351 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CLN3-247ENST00000636351 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CLN3-247ENST00000636351 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.05■■□□□ 1.12
CLN3-247ENST00000636351 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CLN3-247ENST00000636351 F8W031 263 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CLN3-247ENST00000636351 SREBF2Q12772 1141 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN3-247ENST00000636351 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.04■■□□□ 1.12
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