RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.15□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 MICALL1Q8N3F8 863 aa7.15□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 RAB17Q9H0T7 212 aa7.15□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 GSTA5Q7RTV2 222 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC68Q9H2F9 335 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 MED4Q9NPJ6 270 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 RNF40O75150 1001 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 KRT3P12035 628 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 STK3Q13188 491 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 CEP57Q86XR8 500 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 IWS1Q96ST2 819 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 IDH1O75874 414 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 BRD3Q15059 726 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 IQUBQ8NA54 791 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 AOX1Q06278 1338 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 F8W8V4 182 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 GFAPP14136 432 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC125Q86Z20 511 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 CECR2Q9BXF3 1484 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 ASPHQ12797 758 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC63Q8NA47 563 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 HAUS1Q96CS2 278 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 FAM81BQ96LP2 452 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 HOMER3Q9NSC5 361 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 A0A1B0GW55 424 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 GNA14O95837 355 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC170Q8IYT3 715 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 SDCCAG3Q96C92 435 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 DUX4Q9UBX2 424 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 LCMT1Q9UIC8 334 aa7.14□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 H0YCG3 227 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 CRCPO75575 148 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 ALDH1L1O75891 902 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 MAP3K7CLP57077 242 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 SLC17A8Q8NDX2 589 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 GRK7Q8WTQ7 553 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 LZTS2Q9BRK4 669 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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SCN2A-209ENST00000636071 PHBP35232 272 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 PPP1R7Q15435 360 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 CEP85LQ5SZL2 805 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 RTEL1Q9NZ71 1219 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 TRIM75PA6NK02 468 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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SCN2A-209ENST00000636071 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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SCN2A-209ENST00000636071 UBA5Q9GZZ9 404 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 KRT79Q5XKE5 535 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 TMTC1Q8IUR5 882 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 NEK1Q96PY6 1258 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 SYT1P21579 422 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 SSFA2P28290 1259 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 NUP160Q12769 1436 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 ZPR1O75312 459 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 ARHGAP4P98171 946 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 HAUS3Q68CZ6 603 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 JRKLQ9Y4A0 524 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 PHACTR2O75167 634 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 CYP26C1Q6V0L0 522 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 RNF8O76064 485 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 PPP2R5AQ15172 486 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 CNNM4Q6P4Q7 775 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC89Q8N998 374 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 ITIH3Q06033 890 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 HOMEZQ8IX15 550 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 TSC1Q92574 1164 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 KIFC3Q9BVG8 833 aa7.12□□□□□ -1.27
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