RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626631.1

TCF4-256, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 2

Gene TCF4, Length 622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-256	ENST00000626631	MED23	Q9ULK4	1368 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	TM4SF4	P48230	202 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	MMP14	P50281	582 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	MXD3	Q9BW11	206 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	CENPF	P49454	3210 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	WNT10B	O00744	389 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	NUBP1	P53384	320 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	IFNL1	Q8IU54	200 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	COA1	Q9GZY4	146 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	CSF1R	P07333	972 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	CASP7	P55210	303 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	G2E3	Q7L622	706 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	OGFOD1	Q8N543	542 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	TBC1D8	O95759	1140 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	SOX10	P56693	466 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	CCDC27	Q2M243	656 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	ITGA6	P23229	1130 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	KLRK1	P26718	216 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	GCKR	Q14397	625 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	STK31	Q9BXU1	1019 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-256	ENST00000626631	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	GPR25	O00155	361 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	SASH1	O94885	1247 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	WWC1	Q8IX03	1113 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	MYH3	P11055	1940 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	NF2	P35240	595 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	GTF2I	P78347	998 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	FLII	Q13045	1269 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	CCDC184	Q52MB2	194 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	SPRYD7	Q5W111	196 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	CERS5	Q8N5B7	392 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	LINS1	Q8NG48	757 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	FBXW7	Q969H0	707 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	CD209	Q9NNX6	404 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	BRCA2	P51587	3418 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	IL16	Q14005	1332 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	SNAP23	O00161	211 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	FOXO4	P98177	505 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	CHRND	Q07001	517 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	SREBF2	Q12772	1141 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	PRKG1	Q13976	671 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	MAP3K11	Q16584	847 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	OCEL1	Q9H607	264 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	FAM205C	A6NFA0	338 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	UNCX	A6NJT0	531 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	FKTN	O75072	461 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	VAMP4	O75379	141 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	TAF5L	O75529	589 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	IL1R1	P14778	569 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	INHBE	P58166	350 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	DLGAP5	Q15398	846 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-256	ENST00000626631	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8

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