RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623171.1

TMEM5-208, Transcript of UDP-D-xylose:ribitol-5-phosphate beta1,4-xylosyltransferase, human

Gene TMEM5, Length 4,531 nt, Biotype TEC, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM5-208	ENST00000623171	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	IGHD	P01880	384 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	PPP2R5E	Q16537	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	RNF135	Q8IUD6	432 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	YY1AP1	Q9H869	796 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	FIBP	O43427	364 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	HIP1R	O75146	1068 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	TUBB4B	P68371	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	CHADL	Q6NUI6	762 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	SMC2	O95347	1197 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	RXRB	P28702	533 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	ITK	Q08881	620 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	PTGDR	Q13258	359 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	MLEC	Q14165	292 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	MPND	Q8N594	471 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	NGLY1	Q96IV0	654 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	LDHC	P07864	332 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	BIRC3	Q13489	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	PPFIA3	O75145	1194 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	HSPA2	P54652	639 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	SATB1	Q01826	763 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	TRDN	Q13061	729 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	MFSD10	Q14728	455 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	DBN1	Q16643	649 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	SPATA24	Q86W54	205 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	ZMYM3	Q14202	1370 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	CAND2	O75155	1236 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	CDC27	P30260	824 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	ATIC	P31939	592 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	GYS2	P54840	703 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	NUCB1	Q02818	461 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	LCA5	Q86VQ0	697 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	CCT6B	Q92526	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	ERVK-7	P63135	1459 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171		A6NNZ2	444 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	EBAG9	O00559	213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	FDX1	P10109	184 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	CASQ1	P31415	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	SEPT6	Q14141	434 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	SIX5	Q8N196	739 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	KIF3C	O14782	793 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	NEBL	O76041	1014 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	BPNT1	O95861	308 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	TUBB	P07437	444 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	GUCA2A	Q02747	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	TRIM29	Q14134	588 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	KCTD2	Q14681	263 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMEM5-208	ENST00000623171	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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