RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610023.1

PDE4C-217, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4C, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-217ENST00000610023 SCARF1Q14162 830 aa26.53■■□□□ 1.84
PDE4C-217ENST00000610023 ZNF408Q9H9D4 720 aa26.53■■□□□ 1.84
PDE4C-217ENST00000610023 COPRSQ9NQ92 184 aa26.53■■□□□ 1.84
PDE4C-217ENST00000610023 JAG2Q9Y219 1238 aa26.53■■□□□ 1.84
PDE4C-217ENST00000610023 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.53■■□□□ 1.84
PDE4C-217ENST00000610023 ADM5C9JUS6 153 aa26.52■■□□□ 1.84
PDE4C-217ENST00000610023 SASH1O94885 1247 aa26.52■■□□□ 1.84
PDE4C-217ENST00000610023 RLBP1P12271 317 aa26.52■■□□□ 1.84
PDE4C-217ENST00000610023 SLC5A1P13866 664 aa26.52■■□□□ 1.84
PDE4C-217ENST00000610023 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PDE4C-217ENST00000610023 CST9Q5W186 159 aa26.52■■□□□ 1.84
PDE4C-217ENST00000610023 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.52■■□□□ 1.84
PDE4C-217ENST00000610023 SULF1Q8IWU6 871 aa26.52■■□□□ 1.84
PDE4C-217ENST00000610023 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa26.52■■□□□ 1.84
PDE4C-217ENST00000610023 RASSF10A6NK89 507 aa26.51■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 IL15P40933 162 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 LPIN2Q92539 896 aa26.51■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.51■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 ECM29Q5VYK3 1845 aa26.51■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 WNT10BO00744 389 aa26.49■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 ATP2B3Q16720 1220 aa26.49■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 NBPF9Q3BBW0 867 aa26.49■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 TLL2Q9Y6L7 1015 aa26.49■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 F8W031 263 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 DEFB115Q30KQ5 88 aa26.48■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.48■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.48■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 MS4A1P11836 297 aa26.47■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 BCAMP50895 628 aa26.47■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 THSD7BQ9C0I4 1608 aa26.47■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.46■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 DLK2Q6UY11 383 aa26.46■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 PCNTO95613 3336 aa26.45■■□□□ 1.83
PDE4C-217ENST00000610023 VEGFBP49765 207 aa26.45■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 DLGAP5Q15398 846 aa26.45■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 PANK1Q8TE04 598 aa26.45■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 CDCA5Q96FF9 252 aa26.45■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 SAPCD2Q86UD0 394 aa26.44■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 MTMR14Q8NCE2 650 aa26.44■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.44■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.44■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 CFAP100Q494V2 611 aa26.43■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa26.42■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 ECE1P42892 770 aa26.41■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 HHIPL1Q96JK4 782 aa26.41■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 SPDYE2BA6NHP3 402 aa26.4■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 SPDYE6P0CI01 402 aa26.4■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 TFCP2Q12800 502 aa26.4■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 POLA2Q14181 598 aa26.4■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 C2orf69Q8N8R5 385 aa26.4■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 CAPNS2Q96L46 248 aa26.4■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 AKAP2Q9Y2D5 859 aa26.4■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 MYO1BO43795 1136 aa26.39■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP26.39■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 ATP8B2P98198 1209 aa26.39■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP26.39■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 CYP4F22Q6NT55 531 aa26.39■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 SSH3Q8TE77 659 aa26.39■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 SERPINA10Q9UK55 444 aa26.39■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa26.39■■□□□ 1.82
PDE4C-217ENST00000610023 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 HUNKP57058 714 aa26.38■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 GRM1Q13255 1194 aa26.38■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 A0A1B0GUL7 405 aa26.37■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 ADORA1P30542 326 aa26.37■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 PHKA1P46020 1223 aa26.37■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 WDR66Q8TBY9 1149 aa26.37■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 MAST3O60307 1309 aa26.37■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 GRIK5Q16478 980 aa26.36■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.36■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.36■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 CLRN2A0PK11 232 aa26.35■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 SEMA3EO15041 775 aa26.35■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 CRKP46108 304 aa26.35■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 CCDC102BQ68D86 513 aa26.35■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 COG6Q9Y2V7 657 aa26.35■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 NF2P35240 595 aa26.34■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 TIMM10P62072 90 aa26.34■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 FKBP1BP68106 108 aa26.34■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 CEP85Q6P2H3 762 aa26.34■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 DENND2AQ9ULE3 1009 aa26.34■■□□□ 1.81
PDE4C-217ENST00000610023 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
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