RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.39■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.39■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 DEFB129Q9H1M3 183 aa24.39■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.39■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 IGKV5-2P06315 115 aa24.38■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 IREB2P48200 963 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.38■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 CRHR2Q13324 411 aa24.37■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.37■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 MYH3P11055 1940 aa24.37■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 ECM29Q5VYK3 1845 aa24.36■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 CTSWP56202 376 aa24.36■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 DLGAP5Q15398 846 aa24.36■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.36■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 KIAA0825Q8IV33 1275 aa24.36■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF333Q96JL9 665 aa24.36■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.36■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.35■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.35■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 MXD3Q9BW11 206 aa24.35■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.34■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa24.33■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.33■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 HTTP42858 3142 aa24.33■■□□□ 1.49
SGMS1-208ENST00000608287 SPEF2Q9C093 1822 aa24.33■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.33■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 F6X3S4 739 aa24.31■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 LINS1Q8NG48 757 aa24.31■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 CLMNQ96JQ2 1002 aa24.31■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa24.3■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 GTF2IP78347 998 aa24.3■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 GCKRQ14397 625 aa24.3■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 CEP290O15078 2479 aa24.29■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 KCNJ4P48050 445 aa24.29■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 TNFAIP1Q13829 316 aa24.29■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.29■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.29■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.29■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 H7C1W4 665 aa24.28■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.28■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 KIF22Q14807 665 aa24.27■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.27■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 GREM2Q9H772 168 aa24.27■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 FZD1Q9UP38 647 aa24.27■■□□□ 1.48
SGMS1-208ENST00000608287 H0YGN5 161 aa24.26■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 GNRH1P01148 92 aa24.26■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 BEND3Q5T5X7 828 aa24.26■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.26■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.26■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.25■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.25■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 OTUD5Q96G74 571 aa24.25■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 VEZTQ9HBM0 779 aa24.25■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.25■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 GTF2A2P52657 109 aa24.24■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 PRMT2P55345 433 aa24.24■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 CENPFP49454 3210 aa24.23■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.23■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 SPDYE6P0CI01 402 aa24.23■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 OPTNQ96CV9 577 aa24.23■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 PTPN18Q99952 460 aa24.23■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 CD209Q9NNX6 404 aa24.23■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 CASP7P55210 303 aa24.22■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.22■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 CFAP100Q494V2 611 aa24.22■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 CHRDL2Q6WN34 429 aa24.22■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.22■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.22■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 PTPRCP08575 1304 aa24.21■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 DLL1O00548 723 aa24.21■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 GJA5P36382 358 aa24.21■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SGMS1-208ENST00000608287 OTOFQ9HC10 1997 aa24.2■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 CLRN2A0PK11 232 aa24.2■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.2■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.2■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 DPF3Q92784 378 aa24.2■■□□□ 1.46
SGMS1-208ENST00000608287 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.2■■□□□ 1.46
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