RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 SULF1Q8IWU6 871 aa21.42■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.42■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.42■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.42■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.41■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 USP48Q86UV5 1035 aa21.41■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 ADM5C9JUS6 153 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 WNT10BO00744 389 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 SRGAP3O43295 1099 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 LPIN2Q92539 896 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 HHIPL1Q96JK4 782 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 SIL1Q9H173 461 aa21.4■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 SLC5A1P13866 664 aa21.39■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.39■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.39■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 VPS37DQ86XT2 251 aa21.39■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.39■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 RLBP1P12271 317 aa21.38■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 VEGFBP49765 207 aa21.38■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.38■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.38■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 ATP2B3Q16720 1220 aa21.37■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.37■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 ZBTB22O15209 634 aa21.36■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.36■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 CDCA5Q96FF9 252 aa21.36■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.36■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 JAG2Q9Y219 1238 aa21.36■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 MS4A1P11836 297 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 ECE1P42892 770 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 DLGAP5Q15398 846 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 BCAMP50895 628 aa21.34■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 DLK2Q6UY11 383 aa21.34■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa21.33■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.33■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 SPDYE6P0CI01 402 aa21.33■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 CAPNS2Q96L46 248 aa21.33■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.33■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.33■■□□□ 1.01
HERC3-214ENST00000601319 F8W031 263 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 POLA2Q14181 598 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 CFAP100Q494V2 611 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 LAMB1P07942 1786 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 SEMA3EO15041 775 aa21.31■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 FKBP1BP68106 108 aa21.31■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 C2orf69Q8N8R5 385 aa21.31■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 SSH3Q8TE77 659 aa21.31■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.31■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 MYO1BO43795 1136 aa21.3■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 HUNKP57058 714 aa21.3■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.3■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 PANK1Q8TE04 598 aa21.3■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 MAST3O60307 1309 aa21.29■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.29■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.29■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.28■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 ATP8B2P98198 1209 aa21.28■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 TFCP2Q12800 502 aa21.28■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.28■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.28■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 OTOFQ9HC10 1997 aa21.27■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 A0A1B0GUL7 405 aa21.27■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 MAP2K2P36507 400 aa21.27■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 CRKP46108 304 aa21.27■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 GRIK5Q16478 980 aa21.27■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 MRIQ9BWK5 157 aa21.27■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.27■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 MAST2Q6P0Q8 1798 aa21.27■■□□□ 1
HERC3-214ENST00000601319 ADORA1P30542 326 aa21.26■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 NF2P35240 595 aa21.26■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 PHKA1P46020 1223 aa21.26■□□□□ 0.99
HERC3-214ENST00000601319 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
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