RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 SERTM1A2A2V5 107 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 NID1P14543 1247 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 ADH7P40394 386 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 SPEM2Q0P670 501 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 RGL3Q3MIN7 710 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 C14orf37Q86TY3 774 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 ABCC11Q96J66 1382 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 USP17L5A8MUK1 530 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.92□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.92□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 BRD7Q9NPI1 651 aa7.92□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 USP17L3A6NCW0 530 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 USP17L4A6NCW7 530 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 CEP63Q96MT8 703 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 DLC1Q96QB1 1528 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 ADGRB2O60241 1585 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 ABCA3Q99758 1704 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 ATP9BO43861 1147 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 TYRO3Q06418 890 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 STK26Q9P289 416 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-212ENST00000597259 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 KIF1AQ12756 1690 aa7.89□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 SFI1A8K8P3 1242 aa7.89□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 CLDN10P78369 228 aa7.89□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.89□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa7.89□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 AFF2P51816 1311 aa7.88□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 BHMTQ93088 406 aa7.88□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 NACC1Q96RE7 527 aa7.88□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.88□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.88□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 ALS2Q96Q42 1657 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 SELPP16109 830 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 KCNQ4P56696 695 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 NEUROD1Q13562 356 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 ARTNQ5T4W7 220 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 CCDC102BQ68D86 513 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 SUSD3Q96L08 255 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 BCL9LQ86UU0 1499 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 RGS12O14924 1447 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 MBTPS1Q14703 1052 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 TRIM50Q86XT4 487 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 A0A0A0MRY4 1105 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 FOXO3O43524 673 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 LILRB5O75023 590 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 ADGRE1Q14246 886 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 IGFLR1Q9H665 355 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 ATRNO75882 1429 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-212ENST00000597259 GLI3P10071 1580 aa7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms