RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596309.5

FCHO1-212, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-212ENST00000596309 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.73■■□□□ 1.39
FCHO1-212ENST00000596309 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
FCHO1-212ENST00000596309 GMLQ99445 158 aa23.73■■□□□ 1.39
FCHO1-212ENST00000596309 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.73■■□□□ 1.39
FCHO1-212ENST00000596309 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
FCHO1-212ENST00000596309 H7C1D1 291 aa23.72■■□□□ 1.39
FCHO1-212ENST00000596309 ADORA1P30542 326 aa23.72■■□□□ 1.39
FCHO1-212ENST00000596309 AACSQ86V21 672 aa23.72■■□□□ 1.39
FCHO1-212ENST00000596309 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
FCHO1-212ENST00000596309 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
FCHO1-212ENST00000596309 RRAGCQ9HB90 399 aa23.72■■□□□ 1.39
FCHO1-212ENST00000596309 POTECB2RU33 542 aa23.71■■□□□ 1.39
FCHO1-212ENST00000596309 IGSF3O75054 1194 aa23.71■■□□□ 1.39
FCHO1-212ENST00000596309 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
FCHO1-212ENST00000596309 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
FCHO1-212ENST00000596309 PHKA1P46020 1223 aa23.71■■□□□ 1.39
FCHO1-212ENST00000596309 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
FCHO1-212ENST00000596309 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
FCHO1-212ENST00000596309 FBXW7Q969H0 707 aa23.71■■□□□ 1.39
FCHO1-212ENST00000596309 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
FCHO1-212ENST00000596309 OGFOD1Q8N543 542 aa23.7■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.7■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.7■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.7■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 APBB1O00213 710 aa23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 USP17L8P0C7I0 530 aa23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 EPHX2P34913 555 aa23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.68■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.68■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 SMC5Q8IY18 1101 aa23.68■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.67■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 MICALL2Q8IY33 904 aa23.67■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 MRIQ9BWK5 157 aa23.67■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 MAST3O60307 1309 aa23.66■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 KIF3CO14782 793 aa23.66■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 EPS15P42566 896 aa23.66■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 RASGRF1Q13972 1273 aa23.66■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 SPATA5Q8NB90 893 aa23.65■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 GPATCH3Q96I76 525 aa23.65■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
FCHO1-212ENST00000596309 CERS5Q8N5B7 392 aa23.64■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 TOMM70O94826 608 aa23.63■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 LDHDQ86WU2 507 aa23.63■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.63■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.63■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.63■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 IGHDP01880 384 aa23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 MXD3Q9BW11 206 aa23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 MCAMP43121 646 aa23.61■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 ATP5JP18859 108 aa23.6■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.6■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 SLF2Q8IX21 1173 aa23.6■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.6■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.6■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 JAG2Q9Y219 1238 aa23.6■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.59■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 NUCB1Q02818 461 aa23.58■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 FSTL1Q12841 308 aa23.58■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.58■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.58■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.58■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.58■■□□□ 1.37
FCHO1-212ENST00000596309 ERC2O15083 957 aa23.57■■□□□ 1.36
FCHO1-212ENST00000596309 DLGAP5Q15398 846 aa23.57■■□□□ 1.36
FCHO1-212ENST00000596309 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.57■■□□□ 1.36
FCHO1-212ENST00000596309 TEKT1Q969V4 418 aa23.57■■□□□ 1.36
FCHO1-212ENST00000596309 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.56■■□□□ 1.36
FCHO1-212ENST00000596309 SCARF1Q14162 830 aa23.56■■□□□ 1.36
FCHO1-212ENST00000596309 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
FCHO1-212ENST00000596309 CHADLQ6NUI6 762 aa23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms